整體資產置換不產生流轉稅的納稅義務問題，只涉及所得稅問題。
1.換出
會計上對換出的整體資產不確認銷售實現，只有涉及補價時，收到補價的一方應按上期方法1確認收益。
國家稅務總局《關于企業(yè)股權投資業(yè)務若干所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2000]118號）規(guī)定，在整體資產置換交易中，作為資產置換交易補價的貨幣性資產占換入總資產公允價值不高于25％的，經稅務機關審核確認，資產置換雙方企業(yè)可以均不確認資產轉讓的所得或損失。上述條件稱為免稅重組（指企業(yè)所得稅）條件。國家稅務總局《關于執(zhí)行〈企業(yè)會計制度〉需要明確的有關所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2003]45號）補充規(guī)定，符合118號文件暫不確認資產轉讓所得的企業(yè)在整體資產轉讓、整體資產置換業(yè)務中，取得補價或非股權支付額的企業(yè)，應將所轉讓或處置資產中包含的與補價或非股權支付額相對應的增值，確認為當期應納稅所得額。這樣就與會計準則和會計制度中確認非貨幣性交易補價中所包含的收益相一致了。但是，不符合上述免稅重組條件的，整體資產換出方應確認全部資產轉讓所得或損失。
2.換入
企業(yè)若以整體資產置換方式換入非貨幣性資產，如屬應稅重組，則應將其交易分解為按公允價值銷售全部資產和按公允價值購買另一方全部資產的經濟業(yè)務進行所得稅處理，即換入資產應按資產的公允價值入賬。如屬免稅重組，則交易雙方換入資產的成本應按換出資產的原賬面凈值為基礎確定。例：江西智董公司將其整體資產經評估與江西貴忱公司的整體資產相交換，雙方在資產評估基準日的資產和負債情況為：江西智董公司全部資產賬面價值3000萬元，公允價值4200萬元。其中，存貨賬面價值900萬元，公允價值1350萬元；長期股權投資賬面價值600萬元，公允價值900萬元；固定資產賬面價值900萬元，公允價值1200萬元；無形資產賬面價值600萬元，公允價值750萬元。江西貴忱公司經營活動的全部資產賬面價值3000萬元，公允價值4050萬元。其中，存貨賬面價值600萬元，公允價值1050萬元；長期股權投資賬面價值750萬元，公允價值450萬元；固定資產賬面價值750萬元，公允價值1200萬元；無形資產賬面價值900萬元，公允價值1350萬元。差額150萬元由江西貴忱公司以銀行存款支付。假設資產置換不符合免稅重組的條件，企業(yè)所得稅稅率為33％。
1.江西智董公司轉讓所得如何確定？
公司總資產賬面價值3000萬元，公允價值4200萬元，轉讓所得1200萬元。其中存貨銷售所得450萬元，長期股權投資轉讓所得300萬元，固定資產轉讓所得300萬元，無形資產轉讓所得150萬元。
2.江西智董公司應納所得稅多少？
江西智董公司取得轉讓所得1200萬元，加上已確認的收益42.86萬元（根據方法1計算），合計應納所得稅（1200＋42.86）×33％=410.14（萬元）。剩余832.72萬元應作為未分配利潤或計入任意盈余公積，但不能直接轉入資本公積。
3.江西貴忱公司的股權轉讓損失如何處理？
江西貴忱公司總資產賬面價值3000萬元，公允價值為4050萬元，應確認存貨銷售所得450萬元，長期股權投資轉讓損失300萬元，固定資產轉讓所得450萬元，無形資產轉讓所得450萬元。如果江西貴忱公司在整體資產置換業(yè)務發(fā)生的納稅年度沒有足夠的股權投資收益和其他投資轉讓所得可以沖抵這筆股權轉讓損失，企業(yè)不能直接將該筆股權轉讓損失與其他資產轉讓所得直接相抵。
4.江西貴忱公司應如何繳納企業(yè)所得稅？
同樣，江西貴忱公司應依法計算繳納企業(yè)所得稅，剩余部分也應作為未分配利潤或計入任意盈余公積，但不能直接轉入資本公積。