根據《中華人民共和國土地增值稅暫行條例》第六條和《中華人民共和國土地增值稅暫行條例實施細則》第七條的規(guī)定，對于企業(yè)因違約而承受的處罰性開支，如土地閑置費及契稅滯納金等，不屬于按稅法規(guī)定正常開支的成本費用和國家統(tǒng)一規(guī)定交納的有關費用，也不屬于在轉讓環(huán)節(jié)繳納稅金的范疇，不能作為扣除項目金額。因此，在計征土地增值稅時不能予以扣除。