2009年1月1日起，《中華人民共和國增值稅暫行條例》(國務院令第538號)和《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》(財政部 國家稅務總局令第50號)正式實施。此前國家稅務總局發(fā)布的部分增值稅規(guī)范性文件所引用的條例及細則條款依據(jù)已發(fā)生變化，需要根據(jù)修訂后的條例及細則進行修改。現(xiàn)將有關修改內容明確如下：
一、《國家稅務總局關于飲食業(yè)征收流轉稅問題的通知》(國稅發(fā)〔1996〕202號)第二條中“按《增值稅暫行條例實施細則》第六條和《營業(yè)稅暫行條例實施細則》第六條”修改為“按《增值稅暫行條例實施細則》第七條和《營業(yè)稅暫行條例實施細則》第八條”。
二、《國家稅務總局關于衛(wèi)生防疫站調撥生物制品及藥械征收增值稅的批復》(國稅函〔1999〕191號)中“根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第二十四條及有關規(guī)定，對衛(wèi)生防疫站調撥生物制品和藥械，可按照小規(guī)模商業(yè)企業(yè)4％的增值稅征收率征收增值稅。”修改為“根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第二十九條及有關規(guī)定，對衛(wèi)生防疫站調撥生物制品和藥械，可按照小規(guī)模納稅人3%的增值稅征收率征收增值稅。”
三、《國家稅務總局關于外國企業(yè)來華參展后銷售展品有關稅務處理問題的批復》(國稅函〔1999〕207號)第一條中“按小規(guī)模納稅人所適用的6%征收率”修改為“按小規(guī)模納稅人所適用的3%征收率”。
四、《國家稅務總局關于增值稅一般納稅人恢復抵扣進項稅額資格后有關問題的批復》(國稅函〔2000〕584號)中“《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第三十條規(guī)定：‘一般納稅人有下列情形之一者，應按銷售額依照增值稅稅率計算應納稅額，不得抵扣進項稅額，也不得使用增值稅專用發(fā)票：(一)會計核算不健全，或者不能夠提供準確稅務資料的；(二)符合一般納稅人條件，但不申請辦理一般納稅人認定手續(xù)的。’”修改為 “《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第三十四條規(guī)定：有下列情形之一者，應按銷售額依照增值稅稅率計算應納稅額，不得抵扣進項稅額，也不得使用增值稅專用發(fā)票:(一)一般納稅人會計核算不健全，或者不能夠提供準確稅務資料的；(二)除本細則第二十九條規(guī)定外，納稅人銷售額超過小規(guī)模納稅人標準，未申請辦理一般納稅人認定手續(xù)的。”
五、《國家稅務總局關于企業(yè)改制中資產(chǎn)評估減值發(fā)生的流動資產(chǎn)損失進項稅額抵扣問題的批復》(國稅函〔2002〕1103號)中“《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第二十一條規(guī)定：‘非正常損失是指生產(chǎn)、經(jīng)營過程中正常損耗外的損失’”修改為 “《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第二十四條規(guī)定，非正常損失是指因管理不善造成被盜、丟失、霉爛變質的損失。”。
六、《國家稅務總局關于增值稅起征點調整后有關問題的批復》(國稅函〔2003〕1396號)第二條“《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十八條規(guī)定”修改為“《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十七條規(guī)定”。
七、《國家稅務總局關于加強新辦商貿(mào)企業(yè)增值稅征收管理有關問題的緊急通知》(國稅發(fā)明電〔2004〕37號)第三條第(三)款有關企業(yè)增購專用發(fā)票必須按專用發(fā)票銷售額的4%預繳增值稅的規(guī)定，修改為按3%預繳增值稅。
八、《國家稅務總局關于加強新辦商貿(mào)企業(yè)增值稅征收管理有關問題的補充通知》(國稅發(fā)明電〔2004〕62號)第七條第一款有關輔導期一般納稅人增購增值稅專用發(fā)票按4%征收率計算預繳稅款的規(guī)定，修改為按3%征收率計算預繳稅款。
九、《國家稅務總局關于取消小規(guī)模企業(yè)銷售貨物或應稅勞務由稅務所代開增值稅專用發(fā)票審批后有關問題的通知》(國稅函〔2004〕895號)第一條“增值稅征收率4%(商業(yè))或6%(其他)”修改為“增值稅征收率3%”。
十、《國家稅務總局關于加強煤炭行業(yè)稅收管理的通知》(國稅發(fā)〔2005〕153號)第一條“根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第三十條的規(guī)定”修改為“根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第三十四條的規(guī)定”。
十一、《國家稅務總局關于納稅人進口貨物增值稅進項稅額抵扣有關問題的通知》(國稅函〔2007〕350號)中“納稅人從海關取得的完稅憑證”修改為“納稅人從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書”，“進口貨物取得的合法海關完稅憑證”修改為“進口貨物取得的合法海關進口增值稅專用繳款書”。
