第一步：做好基礎(chǔ)準(zhǔn)備。匯算清繳前，納稅人應(yīng)加強(qiáng)人才儲備和知識儲備，梳理各項稅收政策，注重企業(yè)所得稅相關(guān)知識的學(xué)習(xí)；關(guān)注稅務(wù)機(jī)關(guān)辦稅服務(wù)廳、12366納稅服務(wù)熱線等關(guān)于匯算清繳的要求，積極參加稅務(wù)機(jī)關(guān)組織的培訓(xùn)會與輔導(dǎo)會，了解匯算清繳的工作程序和要求，掌握企業(yè)所得稅相關(guān)政策規(guī)定；先期做好年度財務(wù)決算和財務(wù)審計工作，同時做好企業(yè)內(nèi)部匯算清繳的培訓(xùn)和管理，提高匯算清繳整體管理質(zhì)量和效率。
第二步：全面統(tǒng)籌匯繳。企業(yè)應(yīng)及早制定匯算清繳計劃，特別是跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)總機(jī)構(gòu)應(yīng)要求分支機(jī)構(gòu)提前進(jìn)行納稅申報，為總機(jī)構(gòu)匯總申報預(yù)留時間。同時，為了規(guī)范集團(tuán)企業(yè)的匯算清繳工作，最好制定具體的操作手冊。比如，為規(guī)范集團(tuán)所得稅匯算清繳管理，某企業(yè)就制定了《集團(tuán)公司企業(yè)所得稅匯算清繳管理手冊》，歸納了該企業(yè)所屬行業(yè)適用的匯算清繳政策，制定了匯算清繳績效管理考核辦法，值得大企業(yè)借鑒。
第三步：加強(qiáng)內(nèi)部協(xié)調(diào)。年度納稅申報需要報備、審批的資料和年度納稅申報表填報調(diào)整的事項，幾乎涉及納稅人的全部生產(chǎn)經(jīng)營活動，需要企業(yè)稅務(wù)管理部門協(xié)調(diào)內(nèi)部各有關(guān)部門提供與匯算清繳有關(guān)的數(shù)據(jù)信息及資料，如人力資源管理、財務(wù)核算、費用報銷、勞資、工會、福利、投資和審計等諸多部門。
第四步：研究新舊政策。由于涉及所得稅的稅收政策相對較多，每年還有一些最新出臺的政策文件，稅務(wù)機(jī)關(guān)在匯算清繳輔導(dǎo)時，不會面面俱到地梳理所有政策。企業(yè)應(yīng)根據(jù)自己的行業(yè)特點，結(jié)合以往稅務(wù)機(jī)關(guān)講解的要點，深入研究與自身業(yè)務(wù)相關(guān)的稅收政策以及主管稅務(wù)機(jī)關(guān)具體執(zhí)行的口徑。
第五步：辦理審批和備案事項。企業(yè)需要報經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)審批、審核或備案的事項，應(yīng)按有關(guān)程序、時限和要求報送材料，在辦理企業(yè)所得稅年度納稅申報前及時辦理。這些事項包括各類稅收優(yōu)惠審批、備案事項，資產(chǎn)損失稅前扣除等申報事項及其他稅前扣除的審批、審核或備案事項。企業(yè)應(yīng)嚴(yán)格按照稅收政策區(qū)分是否享受稅收優(yōu)惠或能否稅前扣除，按照審批、備案事項的要件要求提供備案或附送資料，并注意申報數(shù)據(jù)和事項需要與企業(yè)在年度申報表及附表相一一對應(yīng)。
第六步：審核相關(guān)票據(jù)。納稅人應(yīng)該嚴(yán)格按照發(fā)票管理辦法的規(guī)定、自查發(fā)票管理是否合規(guī)，注意未按規(guī)定取得的合法有效憑據(jù)不得在稅前扣除，未按規(guī)定取得發(fā)票的事項應(yīng)及時補(bǔ)正。
第七步：集中解決政策難題。在所有所得稅政策中，最復(fù)雜、最特殊、最容易帶來風(fēng)險的稅收政策包括并購重組、股權(quán)交易、特別納稅調(diào)整、企業(yè)境外所得稅收抵免、關(guān)聯(lián)交易等事項，這些事項在匯算清繳時納稅人應(yīng)格外注意。如果遇到稅收政策難題，納稅人應(yīng)主動與主管稅務(wù)機(jī)關(guān)保持聯(lián)絡(luò)，關(guān)注主管稅務(wù)機(jī)關(guān)對具體政策執(zhí)行的尺度；遇到政策規(guī)定不清或理解有歧義時，應(yīng)與主管稅務(wù)機(jī)關(guān)及時聯(lián)系，對該政策適用的確定性進(jìn)行確認(rèn)，并可向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)書面請示，并關(guān)注請示結(jié)果。
第八步：開展匯算清繳鑒證。目前，一些省市要求企業(yè)在匯算清繳工作中，提交稅務(wù)師事務(wù)所出具的所得稅匯算清繳鑒證報告，稅務(wù)機(jī)關(guān)越來越重視利用《涉稅鑒證報告》加強(qiáng)稅收管理的工作。在實務(wù)中，一些中介機(jī)構(gòu)在鑒證時只按申報表填表項目羅列一些數(shù)據(jù)，沒有具體審核過程，政策依據(jù)等實質(zhì)內(nèi)容，使稅務(wù)機(jī)關(guān)無法相信鑒證報告的真實性�；诖�，納稅人應(yīng)聘請真正有實力、負(fù)責(zé)人的中介機(jī)構(gòu)開展此項工作。
第九步：填報年度納稅申報表。稅務(wù)機(jī)關(guān)在匯算清繳結(jié)束后，一般會組織人員對年度納稅申報邏輯性和有關(guān)資料的完整性和準(zhǔn)確性進(jìn)行審核。因此，企業(yè)在填報企業(yè)所得稅年度納稅申報表時，除應(yīng)嚴(yán)格按照《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報表及附表填報說明》要求，準(zhǔn)確填報年度納稅申報表外，還應(yīng)重點關(guān)注年度納稅申報表的邏輯性，有關(guān)資料的完整性和準(zhǔn)確性，特別要關(guān)注以下項目。
1.納稅人企業(yè)所得稅年度納稅申報表及其附表與企業(yè)財務(wù)報表有關(guān)項目的數(shù)字是否相符，各項目之間的邏輯關(guān)系是否對應(yīng)，計算是否正確。
2.納稅人是否按規(guī)定彌補(bǔ)以前年度虧損額和結(jié)轉(zhuǎn)以后年度待彌補(bǔ)的虧損額。
3.納稅人是否符合稅收優(yōu)惠條件，稅收優(yōu)惠的確認(rèn)和申請是否符合規(guī)定程序。
4.納稅人稅前扣除的財產(chǎn)損失是否真實，是否符合有關(guān)規(guī)定程序。
5.跨地區(qū)經(jīng)營匯總繳納企業(yè)所得稅的納稅人，其分支機(jī)構(gòu)稅前扣除的財產(chǎn)損失是否由分支機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)出具證明。
6.納稅人企業(yè)所得稅和其他各稅種之間的數(shù)據(jù)是否相符、邏輯關(guān)系是否吻合。
第十步：報送納稅申報有關(guān)資料。納稅人辦理企業(yè)所得稅年度納稅申報時，除報送《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報表及附表》、《中華人民共和國企業(yè)年度關(guān)聯(lián)業(yè)務(wù)往來報告表》外，應(yīng)如實填寫和報送下列有關(guān)資料：（一）企業(yè)所得稅年度納稅申報表及其附表；（二）財務(wù)報表；（三）備案事項相關(guān)資料；（四）總機(jī)構(gòu)及分支機(jī)構(gòu)基本情況、分支機(jī)構(gòu)征稅方式、分支機(jī)構(gòu)的預(yù)繳稅情況；（五）委托中介機(jī)構(gòu)代理納稅申報的，應(yīng)出具雙方簽訂的代理合同，并附送中介機(jī)構(gòu)出具的包括納稅調(diào)整的項目、原因、依據(jù)、計算過程、調(diào)整金額等內(nèi)容的報告；（六）涉及關(guān)聯(lián)方業(yè)務(wù)往來的，同時報送《中華人民共和國企業(yè)年度關(guān)聯(lián)業(yè)務(wù)往來報告表》等。納稅人采用電子方式辦理企業(yè)所得稅年度納稅申報的，應(yīng)按照有關(guān)規(guī)定保存有關(guān)資料或附報紙質(zhì)納稅申報資料。
第十一步：關(guān)注退稅要求。按照規(guī)定，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)結(jié)合企業(yè)所得稅預(yù)繳情況及日常征管情況，對企業(yè)報送的年度納稅申報表及其附表和其他有關(guān)資料進(jìn)行初步審核后，按規(guī)定程序及時辦理企業(yè)所得稅補(bǔ)、退稅或抵繳其下一年度應(yīng)納所得稅款等事項。
