規(guī)范科學事業(yè)單位會計核算和會計報表實務的具體行政法規(guī)。現(xiàn)行《科學事業(yè)單位會計制度》由財政部、國家科委于1997年12月16日頒布，自行1998年1月1日起執(zhí)行，共他七章31條。
第一章總則，明確本制度適用于境內(nèi)國有科學事業(yè)單位，包括主管會計單位、上級會計單位和基層會計單位；會計核算應滿足國家預算管理、單位內(nèi)部管理及有關方面了解單位財務狀況的需要；會計核算應當以單位各項業(yè)務活動及其他活動持續(xù)正常地進行為前提；會計記賬方法采用借貸記賬法。
第二章資產(chǎn)計價的一般原則，明確應收及預付款項按實際業(yè)務發(fā)生時的價格或金額計價；存貨按獲取時的實際成本、賬面價值、同類存貨的市場價或評估價計價；購入固定資產(chǎn)，按實際支付的總價款計價；自行建造固定資產(chǎn)按建造中的實際支出計價；無形資產(chǎn)按實際支付的價款、市場價或評估價計價；對外投資按實際支付金額或評估計價。
第三章收入確認原則，明確財政補助收入、上級補助收入、附屬單位上繳收入和其他收入，在實際收到款項時確認為收入；科研收入、技術收入、試制產(chǎn)品收入、不術活動收入、科普活動收入和經(jīng)營收入，在提供科研成果、技術服務、發(fā)出產(chǎn)品等，同時收訖價款或取得索取價款的憑據(jù)時，確認為收入；對于長期項目的收入，須根據(jù)年度完成進度，合理確認為收入；經(jīng)財政部門核準不上繳財政專戶管理的預算外資金，在實際收到款項時確認為收入；財政專戶核撥的預算外資金，在收到資金后，確認為收入。
第四章支出及內(nèi)部成本費用核算原則，明確單位發(fā)生的事業(yè)支出、經(jīng)營支出、結轉自籌基建、對附屬單位補助和上繳上級支出，應正確予以歸集；對從事各項業(yè)務活動發(fā)生的支出，凡無法直接歸集的應按規(guī)定的比例和標準在事業(yè)支出和經(jīng)營支出中進行合理分攤；單位對發(fā)生的事業(yè)支出、經(jīng)營支出，應分別歸集到基本工資、補助工資、其他工資、職工福利費、社會保障費、助學金、公務費、設備購置費、修繕費、業(yè)務費和其他費用、間接費用、期間費用分別歸集，期末按規(guī)定將各項成本費用分別歸集到事業(yè)支出和經(jīng)營支出的相應科目中；成本核算采用制造成本法，對于各項直接費用直接計入各成本核算對象的成本中，對于各項間接費用定期按一定標準分配計入成本核算對象的成本中，對于期間費用定期按規(guī)定的比例和標準分配計入事業(yè)支出和經(jīng)營支出相應的科目中。
第五章會計科目及使用說明，列示了資產(chǎn)類、負債類、凈資產(chǎn)類、收入類、支出類及成本費用類五類會計科目及其使用說明，并對單位根據(jù)實際情況自行增加、減少或合并的會計科目進行了補充說明。
第六章會計報表，規(guī)定會計報表的組成：資產(chǎn)負債表、收入支出表、支出明細表、結余分配表、凈資產(chǎn)變動情況表；規(guī)定單位應按期向有關部門報送會計報表；規(guī)定科學事業(yè)單位的主管部門或單位，應在認真審核所屬單位會計報表基礎上，編制匯總會計報表。
第七章附則，說明經(jīng)有關部門批準，辦理完各項劃轉手續(xù)，已進入企業(yè)（企業(yè)集團）、納入財務管理體系的單位，應執(zhí)行同行業(yè)或接近行業(yè)會計制度。
