增值稅一般納稅人在生產(chǎn)經(jīng)營過程中所支付的運(yùn)輸費(fèi)用如外購和銷售貨物（固定資產(chǎn)除外）所支付的運(yùn)輸費(fèi)用（包括管道運(yùn)輸費(fèi)用），實(shí)行增值稅擴(kuò)大抵扣范圍企業(yè)外購固定資產(chǎn)除外，可以根據(jù)套印有全國統(tǒng)一發(fā)票監(jiān)制章的運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)（普通發(fā)票）所列運(yùn)費(fèi)金額，按購進(jìn)或銷售應(yīng)稅貨物支付的運(yùn)輸費(fèi)用按7%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。一般而言，增值稅一般納稅人準(zhǔn)予抵扣的運(yùn)費(fèi)結(jié)算單據(jù)分為兩種，一種是國有運(yùn)輸單位開具的發(fā)票，是指國有鐵路、民用航空、公路和水上運(yùn)輸單位開具的貨票；一種是從事貨物運(yùn)輸?shù)姆菄羞\(yùn)輸單位開具的套印全國統(tǒng)一發(fā)票監(jiān)制章的貨票，這里的非國有運(yùn)輸單位指的是具有正式運(yùn)營資格的企業(yè)或個體經(jīng)營者。準(zhǔn)予抵扣的貨物運(yùn)費(fèi)金額是指在運(yùn)輸單位開具的貨票上注明的運(yùn)費(fèi)、建設(shè)基金。
根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于運(yùn)輸費(fèi)用和廢舊物資準(zhǔn)予抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額問題的通知》（財(cái)稅字〔1994〕12號）、《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅幾個稅收政策問題的通知》（財(cái)稅字〔1994〕60號）、《增值稅問題解答（之一）》（國稅函發(fā)〔1995〕288號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于加強(qiáng)增值稅征收管理若干問題的通知》（國稅發(fā)〔1995〕192號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于加強(qiáng)增值稅征收管理若干問題的通知》（國稅發(fā)〔1995〕192號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于加強(qiáng)貨物運(yùn)輸業(yè)稅收征收管理的通知》（國稅發(fā)〔2003〕121號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅一般納稅人支付的貨物運(yùn)輸代理費(fèi)用不得抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的批復(fù)》（國稅函〔2005〕54號）、《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅若干政策的通知》（財(cái)稅〔2005〕165號）等相關(guān)規(guī)定，運(yùn)輸費(fèi)用涉稅抵扣有著諸多禁止性規(guī)定，踏入“禁區(qū)”將不能享受相關(guān)的抵扣政策。不準(zhǔn)予抵扣的運(yùn)輸費(fèi)用具體范圍包括：增值稅一般納稅人購進(jìn)或銷售固定資產(chǎn)（東北以外地區(qū)固定資產(chǎn)除外）所發(fā)生的運(yùn)輸費(fèi)用，不得計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。
增值稅一般納稅人購買或銷售免稅貨物所發(fā)生的運(yùn)輸費(fèi)用，不得計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。
隨同運(yùn)費(fèi)支付的裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等其他雜費(fèi)不得計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣，增值稅一般取得貨運(yùn)發(fā)票應(yīng)當(dāng)分別注明運(yùn)費(fèi)和雜費(fèi)，對未分別注明，而合并注明為運(yùn)雜費(fèi)的不予抵扣。
增值稅一般納稅人采取郵寄方式銷售、購買貨物所支付的郵寄費(fèi)，不允許計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。
增值稅一般納稅人購進(jìn)、銷售貨物所支付的運(yùn)輸費(fèi)用明顯偏高、經(jīng)過審查不合理的，不予抵扣運(yùn)輸費(fèi)用。
增值稅一般納稅人發(fā)生的運(yùn)輸費(fèi)用，取得的貨運(yùn)定額發(fā)票，不允許計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。
國際貨物運(yùn)輸代理業(yè)務(wù)是國際貨運(yùn)代理企業(yè)作為委托方和承運(yùn)單位的中介人，受托辦理國際貨物運(yùn)輸和相關(guān)事宜并收取中介報(bào)酬的業(yè)務(wù)。增值稅一般納稅人支付的國際貨物運(yùn)輸代理費(fèi)用，不得作為運(yùn)輸費(fèi)用抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。
增值稅一般納稅人購進(jìn)貨物或應(yīng)稅勞務(wù)，支付運(yùn)輸費(fèi)用，準(zhǔn)予計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額扣除的貨運(yùn)發(fā)票，其發(fā)貨人、收貨人、起運(yùn)地、到達(dá)地、運(yùn)輸方式、貨物名稱、貨物數(shù)量、運(yùn)輸單價(jià)、運(yùn)費(fèi)金額等項(xiàng)目的填寫必須齊全，與購貨發(fā)票（附有運(yùn)輸清單的匯總開具的運(yùn)輸發(fā)票除外）上所列的有關(guān)項(xiàng)目必須相符，否則不予抵扣。一般納稅人購進(jìn)或銷售貨物（東北以外地區(qū)固定資產(chǎn)除外）通過鐵路運(yùn)輸，并取得鐵路部門開具的運(yùn)輸發(fā)票，如果鐵路部門開具的鐵路運(yùn)輸發(fā)票托運(yùn)人或收貨人名稱與其不一致，但鐵路運(yùn)輸發(fā)票《托運(yùn)人》欄或《備注》欄注有該納稅人名稱的（手寫無效），該運(yùn)輸發(fā)票可以作為進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證，允許計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。
除運(yùn)輸單位提供運(yùn)輸勞務(wù)自行開具的運(yùn)輸發(fā)票，運(yùn)輸單位主管地稅局及省級地稅局委托的代開發(fā)票中介機(jī)構(gòu)為運(yùn)輸單位和個人代開的運(yùn)輸發(fā)票準(zhǔn)予抵扣外，其他單位代運(yùn)輸單位和個人開具的運(yùn)輸發(fā)票一律不得抵扣。
一般納稅人取得的匯總開具的運(yùn)輸發(fā)票，未附有運(yùn)輸企業(yè)開具并加蓋財(cái)務(wù)專用章或發(fā)票專用章的運(yùn)輸清單，不允許計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。
另外，根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于東北地區(qū)擴(kuò)大增值稅抵扣范圍若干問題的規(guī)定》（財(cái)稅〔2004〕156號）規(guī)定：黑龍江省、吉林省、遼寧省和大連市從事裝備制造業(yè)、石油化工業(yè)、冶金業(yè)、船舶制造業(yè)、汽車制造業(yè)、農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)產(chǎn)品生產(chǎn)為主的增值稅一般納稅人購進(jìn)（包括接受捐贈和實(shí)物投資）固定資產(chǎn)以及為固定資產(chǎn)所支付的運(yùn)輸費(fèi)用，其進(jìn)項(xiàng)稅額準(zhǔn)予按照規(guī)定抵扣。非試點(diǎn)地區(qū)不得享受上述優(yōu)惠政策。