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一、預(yù)售時的差異：首先是預(yù)繳（征）計稅依據(jù)的差異。其次是預(yù)繳（征）范圍的差異。最后是預(yù)繳（征）率的差異。二、交房時的差異：預(yù)繳增值稅的房地產(chǎn)應(yīng)按適用稅率或征收率計算當(dāng)期應(yīng)納稅額，抵減已預(yù)繳稅款后申報納稅，此時計算當(dāng)期應(yīng)納稅額的計稅依據(jù)與預(yù)繳增值稅的預(yù)繳計稅依據(jù)是一致的。營改增后，納稅人轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)的土地增值稅應(yīng)稅收入不含增值稅。也就是說要對土地增值稅預(yù)征收入進(jìn)行調(diào)整或進(jìn)行負(fù)數(shù)申報。三、清算后的差異：土地增值稅實行先預(yù)征后清算的制度，清算后預(yù)繳增值稅與預(yù)征土地增值稅的差異主要有兩方面：第一，“多退少補(bǔ)”規(guī)定不同。第二，預(yù)繳（征）截止期限不同。