企業(yè)接受稅務稽查后，有的及時處理賬務，進行納稅調整，但也有不少企業(yè)沒有意識到納稅調整的重要性，補繳稅款后就完事，不調整相關賬務，有的雖作賬務調整，但因財務人員業(yè)務不夠熟練，會計處理不當，導致會計資料失真。做好賬務調整是鞏固稽查成果、確保國家稅收的重要一環(huán)，對企業(yè)來說也至關重要，否則可能會造成重復納稅。
稽查后企業(yè)賬務調整存在的主要問題
增值稅方面。1.增值稅銷項稅。（1）少計或不計收入不作調賬處理。主要包括由價外費用、逾期押金、以舊換新銷售、還本銷售等經濟事項引起會計處理上少計或不計收入，少計銷項稅，稅務稽查后不調增銷售收入和銷項稅。（2）視同銷售貨物不計銷項稅，稅務稽查后不調增銷項稅。
2.增值稅進項稅。（1）違規(guī)抵扣行為不調賬。違反《增值稅暫行條例》規(guī)定，將不得從銷項稅額抵扣的進項稅額項目違法抵扣，稅務稽查后不調減進項稅。（2）超前抵扣行為不調賬。未按照國家稅務總局《關于加強增值稅征收管理的通知》規(guī)定的增值稅一般納稅人購進貨物或應稅勞務，其進項稅額申報抵扣的時間執(zhí)行，提前抵扣進項稅額，稅務稽查后不調減進項稅。
企業(yè)所得稅方面。1.對已查企業(yè)既有查補稅前可扣除稅金（營業(yè)稅、房產稅、印花稅、土地增值稅、城建稅、教育費附加），又有查補企業(yè)所得稅問題的，賬務調整差錯率較高，被查企業(yè)在進行賬務處理時，對稅前可扣除稅金又進行了重復列支，造成少繳當年度企業(yè)所得稅。
2.查補企業(yè)所得稅，加收罰款、滯納金，企業(yè)在轉賬時先通過“以前年度損益調整”科目列支后，又從“以前年度損益調整”科目轉入“本年利潤”借方，列為當年支出，軋抵了當年度的利潤總額（年度企業(yè)所得稅申報未作納稅調整）。
3.對房地產開發(fā)企業(yè)查補的未按預收賬款申報繳納的營業(yè)稅、城建稅、教育費附加，被查企業(yè)在作賬務調整時，直接列入“主營業(yè)務稅金附加”，軋抵當年的應納稅所得額。
個人所得稅方面。1.檢查中有的企業(yè)僅按照《稅務行政處罰決定書》上的罰款金額按時解繳入庫，對《涉稅聯(lián)系單》上應補繳的個人所得稅稅款，不僅未向納稅人追繳，也未到有關稅務機關申報繳納。
2.由單位代繳個人所得稅的企業(yè)，在計算繳納時沒有按稅法規(guī)定將不含稅收入換算為應納稅所得額計算個人所得稅，同時在賬務調整中存在問題。如將查補的利息、紅利項目，工資薪金項目的個人所得稅，直接列入“利潤分配”、“應付福利費”、“預算外支出”（事業(yè)單位）科目，少繳個人所得稅。
稅務稽查后調賬的基本原則
本年度錯漏賬目的調整。本年度發(fā)生的錯漏賬目，只影響本年度的稅收，應按正常的會計核算程序和會計制度，調整與本年度相關的賬目，以保證本年度應繳稅金和財務成果核算真實、正確。對流轉稅、財產稅和其他各稅檢查的賬務調整，一般不需要計算分攤，凡查補本年度的流轉稅、財產稅和其他稅，只需按照會計核算程序，調整本年度相關的賬戶即可。但對增值稅一般納稅人，應設立“應交稅金———增值稅檢查調整”專門賬戶核算應補（退）的增值稅。凡檢查后應調減賬面進項稅額或調增銷項稅額和進項稅額轉出的數(shù)額，借記有關科目，貸記本科目；凡檢查后應調增賬面進項稅額或調減銷項稅額和進項稅額轉出的數(shù)額，作與上述相反分錄。全部調賬事項入賬后，應結轉出本賬戶的余額，并對該余額進行處理。
以前年度錯漏賬目的調整。對屬于以前年度的錯漏問題，因為財務決算已結束，一些過渡性的集合分配賬戶及經營收支性賬戶已結賬軋平無余額，錯漏賬目的調整，不可能再按正常的核算程序對有關賬戶一一進行調整，一般在當年的“以前年度損益調整”科目、盤存類延續(xù)性賬目及相關的對應科目進行調整。若檢查期和結算期之間時間間隔較長的，可直接調整“以前年度損益調整”和相關的對應科目，盤存類延續(xù)性賬目可不再調整，以不影響當年的營業(yè)利潤。對查補（退）的以前年度增值稅，為不致混淆當年度的欠稅和留抵稅額，應直接通過“應交稅金———未交增值稅”科目進行調整。