（一）查補(bǔ)偷稅應(yīng)納稅額的確定
增值稅一般納稅人不報(bào)、少報(bào)銷項(xiàng)稅額或多報(bào)進(jìn)項(xiàng)稅額，均影響增值稅的繳納，是偷稅行為。其偷稅數(shù)額應(yīng)當(dāng)按銷項(xiàng)稅額的不報(bào)、少報(bào)部分或進(jìn)項(xiàng)稅額的多報(bào)部分確定。如果銷項(xiàng)、進(jìn)項(xiàng)均查有偷稅問題，其偷稅數(shù)額應(yīng)當(dāng)為兩項(xiàng)偷稅數(shù)額之和。
一般納稅人若采取賬外經(jīng)營(yíng)，即購銷活動(dòng)均不入賬，而造成不繳、少繳增值稅的，其偷稅數(shù)額應(yīng)按賬外經(jīng)營(yíng)部分的銷項(xiàng)稅額抵扣賬外經(jīng)營(yíng)部分中已銷貨物進(jìn)項(xiàng)稅額后的余額確定。此時(shí)偷稅數(shù)額為應(yīng)納稅額。
即：應(yīng)納稅額＝賬外經(jīng)營(yíng)部分銷項(xiàng)稅額－賬外經(jīng)營(yíng)部分中已銷貨物進(jìn)項(xiàng)稅額，
已銷貨物進(jìn)項(xiàng)稅額＝賬外經(jīng)營(yíng)部分購貨的進(jìn)項(xiàng)稅額－賬外經(jīng)營(yíng)部分存貨的進(jìn)項(xiàng)稅額
（二）查補(bǔ)稅款金額的確定
一般納稅人發(fā)生偷稅行為，確定偷稅數(shù)額補(bǔ)征入庫時(shí)，其補(bǔ)稅數(shù)額應(yīng)根據(jù)納稅人不同情況分別處理。即：根據(jù)檢查核實(shí)的一般納稅人與其全部銷項(xiàng)稅額與進(jìn)項(xiàng)稅額（包括當(dāng)期留抵扣稅額），重新計(jì)算當(dāng)期全部應(yīng)納稅額。若應(yīng)納稅額為正數(shù)，應(yīng)當(dāng)作補(bǔ)稅處理；若應(yīng)納稅額為負(fù)數(shù)，應(yīng)按《增值稅日常稽查辦法》的規(guī)定執(zhí)行。
（三）查補(bǔ)稅款的會(huì)計(jì)處理 增值稅經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)檢查后，應(yīng)進(jìn)行相應(yīng)的會(huì)計(jì)調(diào)整。為此，應(yīng)設(shè)立“應(yīng)交稅金——增值稅檢查調(diào)整”賬戶。凡檢查后應(yīng)調(diào)減賬面進(jìn)項(xiàng)稅額或調(diào)增銷項(xiàng)稅額和進(jìn)項(xiàng)稅轉(zhuǎn)出的數(shù)額，借記有關(guān)賬戶，貸記本賬戶；凡檢查后應(yīng)調(diào)增賬面進(jìn)項(xiàng)稅額或調(diào)減銷項(xiàng)稅額和進(jìn)項(xiàng)稅額轉(zhuǎn)出的數(shù)額，借記本賬戶，貸記有關(guān)賬戶；全部調(diào)賬事項(xiàng)入賬后，應(yīng)結(jié)出本賬戶的余額，并對(duì)該余額進(jìn)行處理：
1.若余額在借方，全部視同留抵進(jìn)項(xiàng)稅額，按借方余額數(shù)，借記“應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅（進(jìn)項(xiàng)稅額）”賬戶，貸記本賬戶。
2.若余額在貸方，且“應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅”賬戶無余額，按貸方余額數(shù)，借記本賬戶，貸記“應(yīng)交稅金——未交增值稅”賬戶。
3.若本賬戶余額在貸方，“應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅”賬戶有借方余額且等于或大于這個(gè)貸方余額，按貸方余額數(shù)，借記本賬戶，貸記“應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅”賬戶。
4.若本賬戶余額在貸方，“應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅”賬戶有借方余額但小于這個(gè)貸方余額，應(yīng)將這兩個(gè)賬戶的余額沖出，其差額貸記“應(yīng)交稅金——未交增值稅”賬戶。4.若本賬戶余額在貸方，“應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅”賬戶有借方余額但小于這個(gè)貸方余額，應(yīng)將這兩個(gè)賬戶的余額沖出，其差額貸記“應(yīng)交稅金——未交增值稅”賬戶。
[例] 某工業(yè)企業(yè)為增值稅一般納稅人。12月份增值稅納稅資料：當(dāng)期銷項(xiàng)稅額236000元，當(dāng)期購進(jìn)貨物的進(jìn)項(xiàng)稅額為247000元�！皯�(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅”賬戶的借方余額為11000元。
次年1月15日稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)其檢查時(shí)，發(fā)現(xiàn)有如下兩筆業(yè)務(wù)會(huì)計(jì)處理有誤：
1.12月3日，發(fā)出產(chǎn)品一批用于捐贈(zèng)，成本價(jià)80000元，無同類產(chǎn)品售價(jià)，企業(yè)已作如下會(huì)計(jì)處理：
借：營(yíng)業(yè)外支出 80000http
貸：產(chǎn)成品 80000
2.12月24日，為基建工程購入材料35100元，企業(yè)已作如下會(huì)計(jì)處理：
借：在建工程 30000
應(yīng)交稅金——應(yīng)交增值稅（進(jìn)項(xiàng)稅額）5100
貸：銀行存款 35100
針對(duì)上述問題，應(yīng)作查補(bǔ)稅款的會(huì)計(jì)處理：
1.對(duì)查出的問題進(jìn)行會(huì)計(jì)調(diào)整。
（1）企業(yè)對(duì)外捐贈(zèng)產(chǎn)品，應(yīng)視同銷售，計(jì)算銷項(xiàng)稅額，無同類產(chǎn)品售價(jià)的，按組成計(jì)稅價(jià)格計(jì)算。企業(yè)按成本價(jià)直接沖減產(chǎn)成品，但未計(jì)算銷項(xiàng)稅額，屬偷稅行為。
銷項(xiàng)稅額＝80000×（1＋10％）×17％＝14960（元）
據(jù)此，應(yīng)調(diào)賬如下：
借：營(yíng)業(yè)外支出 14960
貸：應(yīng)交稅金——增值稅檢查調(diào)整 14960
（2）企業(yè)用于非應(yīng)稅項(xiàng)目的購進(jìn)貨物，其進(jìn)項(xiàng)稅額不得抵扣，企業(yè)這種多報(bào)進(jìn)項(xiàng)稅額行為，屬偷稅行為。
據(jù)此，應(yīng)調(diào)賬如下：
借：在建工程 5100
貸：應(yīng)交稅金——增值稅檢查調(diào)整 5100
2.確定企業(yè)偷稅數(shù)額。
份稅數(shù)額＝不報(bào)銷項(xiàng)稅額＋多報(bào)進(jìn)項(xiàng)稅額＝14960＋5100＝20060（元）
3.確定應(yīng)補(bǔ)交稅額。
當(dāng)期應(yīng)補(bǔ)稅額＝236000－247000＋20060＝9060（元）
4.進(jìn)行會(huì)計(jì)處理。
借：應(yīng)交稅金——增值稅檢查調(diào)整 20060
貸：應(yīng)交稅金——未交增值稅 9060
——應(yīng)交增值稅 11000http
補(bǔ)交稅款入庫時(shí)：
借：應(yīng)交稅金——未交增值稅 9060
貸：銀行存款 9060
從此例可見，企業(yè)的偷稅數(shù)額，不一定等于補(bǔ)稅數(shù)額
[例] 某商業(yè)企業(yè)為增值稅一般納稅人，12月份增值稅納稅資料：當(dāng)期銷項(xiàng)稅額50000元，當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額35000元，當(dāng)期已納增值稅15000元。次年年初稅務(wù)機(jī)關(guān)檢查時(shí)，發(fā)現(xiàn)如下兩筆業(yè)務(wù)未作會(huì)計(jì)處理：
1.12月2日，企業(yè)購入商品100件，取得了增值稅專用發(fā)票，注明：價(jià)款50000元，稅款8500元，但未作任何會(huì)計(jì)處理。
2.12月21日，企業(yè)又將上述購入商品出售45件，取得現(xiàn)金35100元，也未作任何會(huì)計(jì)處理。
經(jīng)稅務(wù)人員檢查核實(shí)，認(rèn)定企業(yè)在搞賬外經(jīng)營(yíng)。偷稅數(shù)額如下：
已銷貨物進(jìn)項(xiàng)稅額＝賬外經(jīng)營(yíng)部分購貨的進(jìn)項(xiàng)稅額－賬外經(jīng)營(yíng)部分存貨的進(jìn)項(xiàng)稅額＝8500－8500×55％＝3825（元）
應(yīng)納稅額＝賬外經(jīng)營(yíng)部分銷項(xiàng)稅額－賬外經(jīng)營(yíng)部分中已銷貨物的進(jìn)項(xiàng)稅額 ＝5100－3825＝1275（元）
由于企業(yè)當(dāng)期正常的增值稅稅額核算已經(jīng)結(jié)束，此筆應(yīng)納稅額1275元，既是偷稅數(shù)額，又是補(bǔ)稅數(shù)額（會(huì)計(jì)處理略）。