一、以非貨幣性資產(chǎn)對外投資發(fā)生的評估增值
根據(jù)《公司法》的規(guī)定，企業(yè)以非貨幣性資產(chǎn)投資的，應當對非貨幣性資產(chǎn)進行資產(chǎn)評估，以評估價作為投資額。但企業(yè)會計制度規(guī)定對以非貨幣性資產(chǎn)投資的，應以投出資產(chǎn)的賬面價值加上應支付的相關稅費作為投資的入賬價值。如果涉及補價的，按以下方法確定換入投資的初始投資成本：
1.收到補價的，按換出資產(chǎn)的賬面價值加上應確認的收益和應支付的相關稅費減去補價后的余額，作為初始投資成本；
2.支付補價的，按換出資產(chǎn)的賬面價值加上支付的補價和應支付的相關稅費，作為初始投資成本。
稅法上，對非貨幣性資產(chǎn)投資交易發(fā)生時，應將其分解為按公允價值銷售有關非貨幣性資產(chǎn)和投資兩項經(jīng)濟業(yè)務處理，應將非貨幣性資產(chǎn)的公允價值或評估價超過非貨幣性資產(chǎn)賬面價值的差額確認當期所得。如果視同公允價值銷售的所得數(shù)額較大，納稅有困難的，納稅人可以報經(jīng)稅務機關批準，可作為遞延所得，在投資交易發(fā)生當期及隨后不超過5個納稅年度內(nèi)平均攤銷到各年度的應納稅所得中。作為被投資企業(yè)可以按資產(chǎn)公允價值作為計稅成本，對依法計提的折舊或攤銷、結轉的成本、費用允許稅前扣除。
二、清產(chǎn)核資發(fā)生的資產(chǎn)評估增值
企業(yè)按國務院的規(guī)定進行清產(chǎn)核資或自行聘請社會中介機構進行的資產(chǎn)評估，在會計上，對評估增值的資產(chǎn)，一方面增加相應的資產(chǎn)價值，另一方面增加企業(yè)的資本公積，也就是說，會計上對評估增值部分不確認為企業(yè)的收益。按照成本核算的要求，對資產(chǎn)評估增值部分企業(yè)可以計提折舊和攤銷費用。
在稅法上：公司對資產(chǎn)評估增值既不屬他人的捐贈，也不是企業(yè)實現(xiàn)的利潤，也不屬于《企業(yè)所得稅條例》規(guī)定的應稅收入。因此，對企業(yè)資產(chǎn)評估增值不應當并入應納稅所得額計算繳納企業(yè)所得稅。在折舊、費用的攤銷上，納稅人的存貨、固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)和投資等各項資產(chǎn)成本的確定應遵循歷史成本原則。納稅人發(fā)生合并、分立和資本結構調(diào)整等改組活動，有關資產(chǎn)隱含的增值或損失在稅法上已確認實現(xiàn)的，可按經(jīng)評估確認后的價值確定有關資產(chǎn)的成本。也就是說，只有在企業(yè)改組活動中，企業(yè)將非貨幣性資產(chǎn)視為以公允價值銷售和分配兩項業(yè)務，并按規(guī)定計算財產(chǎn)轉讓所得或損失的情況下，資產(chǎn)的計稅成本可以按評估價確認，由此計提折舊費用并允許稅前扣除。除此之外，都應當遵照歷史成本原則，即依照取得該項資產(chǎn)時的實際成本作為企業(yè)所得稅的計稅成本。
三、企業(yè)改組發(fā)生的資產(chǎn)評估增值
根據(jù)企業(yè)會計制度規(guī)定，企業(yè)合并、兼并、分立一般是按資產(chǎn)的賬面價值加上應支付的相關稅費作為被合并、分立方入賬價值；合并、分立方的資產(chǎn)應當以公允價值作為入賬的依據(jù)。
在企業(yè)所得稅上，原則上應按公允價值轉讓、處置資產(chǎn)，計算資產(chǎn)的轉讓所得，依法繳納企業(yè)所得稅；接受資產(chǎn)方按公允價值作為計稅成本。但根據(jù)（國稅發(fā)[2000]118號）第四條（二）款規(guī)定：“如果企業(yè)整體資產(chǎn)轉讓交易的接受企業(yè)支付的交換額中，除接受企業(yè)股權以外的現(xiàn)金、有價證券、其他資產(chǎn)（以下簡稱”非股權支付額“）不高于所支付的股權的票面價值（或股本的賬面價值）20%的，經(jīng)稅務機關審核確認，轉讓企業(yè)可暫不計算確認資產(chǎn)轉讓所得或損失。接受企業(yè)接受轉讓企業(yè)的資產(chǎn)的成本，須以其在轉讓企業(yè)原賬面凈值為基礎確定，不得按經(jīng)評估確認的價值調(diào)整。”但從2003年1月1日起，對支付現(xiàn)金不高于所支付的股權賬面價值20%的，也可以按評估價值入賬并可在稅前扣除。因為國家稅務總局在《關于執(zhí)行企業(yè)會計制度需要明確的有關所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2003]45號）對此重新規(guī)定為：“符合《國家稅務總局關于企業(yè)股權投資業(yè)務若干問題的通知》（國稅發(fā)[2000]118號）第四條（二）款規(guī)定，轉讓企業(yè)暫不確認資產(chǎn)轉讓所得或損失的整體資產(chǎn)轉讓改組，接受企業(yè)取得的轉讓企業(yè)的資產(chǎn)的成本，可以按評估確認價值確定，不需要進行納稅調(diào)整。”國家稅務總局之所以如此調(diào)整，是因為（國稅發(fā)[2003]45號）規(guī)定：“符合《國家稅務總局關于股權投資業(yè)務若干所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2000]118號）和《國家稅務總局關于企業(yè)合并分立業(yè)務有關所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2000]119號）暫不確認資產(chǎn)轉讓所得的企業(yè)整體資產(chǎn)轉讓、整體資產(chǎn)置換、合并和分立等改組業(yè)務中，取得補價或非股權支付額的企業(yè)，應將所轉讓或處置資產(chǎn)中包含的與補價或非股權支付額相對應的增值，確認為當期應納稅所得”。