國家稅務(wù)總局《關(guān)于建筑企業(yè)所得稅征管有關(guān)問題的通知》（國稅函[2010]39號(hào)）中規(guī)定，對(duì)跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市）經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題進(jìn)行了明確：

　　1、實(shí)行總、分機(jī)構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號(hào)文件規(guī)定，按照“統(tǒng)一計(jì)算、分級(jí)管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫”的辦法計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

　　2、建筑企業(yè)跨地區(qū)設(shè)立的不符合二級(jí)分支機(jī)構(gòu)條件的項(xiàng)目經(jīng)理部（包括與項(xiàng)目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等），應(yīng)匯總到總機(jī)構(gòu)或二級(jí)分支機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算，按照國稅發(fā)[2008]28號(hào)文件規(guī)定的辦法計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

　　3、各地稅務(wù)機(jī)關(guān)自行制定的與國稅函[2010]39號(hào)相抵觸的征管文件，一律停止執(zhí)行并予以糾正；對(duì)按照規(guī)定不應(yīng)就地預(yù)繳而征收了企業(yè)所得稅的，要及時(shí)將稅款返還給企業(yè)。未按國稅函[2010]39號(hào)要求進(jìn)行糾正的，稅務(wù)總局將按照?qǐng)?zhí)法責(zé)任制的有關(guān)規(guī)定嚴(yán)肅處理。