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法律依據(jù)不同：國(guó)有獨(dú)資企業(yè)遵循《全民所有制工業(yè)企業(yè)法》，國(guó)有獨(dú)資公司遵循《公司法》。 治理結(jié)構(gòu)不同：國(guó)有獨(dú)資企業(yè)不設(shè)股東會(huì)，由政府主管部門行使所有者權(quán)利；國(guó)有獨(dú)資公司設(shè)立股東會(huì)，但不設(shè)股東會(huì)的權(quán)力由國(guó)有資產(chǎn)監(jiān)督管理機(jī)構(gòu)行使。 組織形式不同：國(guó)有獨(dú)資企業(yè)屬于非公司制企業(yè)；國(guó)有獨(dú)資公司是公司制企業(yè)，具有法人資格。 管理者產(chǎn)生方式不同：國(guó)有獨(dú)資企業(yè)的廠長(zhǎng)（經(jīng)理）由政府主管部門任命或職工代表大會(huì)選舉；國(guó)有獨(dú)資公司的董事長(zhǎng)、副董事長(zhǎng)、董事等依照公司法的規(guī)定產(chǎn)生。 責(zé)任承擔(dān)不同：國(guó)有獨(dú)資企業(yè)以國(guó)家授予其經(jīng)營(yíng)管理的財(cái)產(chǎn)承擔(dān)民事責(zé)任；國(guó)有獨(dú)資公司以公司全部資產(chǎn)對(duì)公司債務(wù)承擔(dān)責(zé)任。