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你好！申請費、代理費、年費支出計入主營業(yè)務成本核算就可以。根據(jù)《國家稅務總局關于營業(yè)稅若干問題的通知》（國稅發(fā)[1995]76號》第四條規(guī)定：代理業(yè)的營業(yè)額為納稅人從事代理業(yè)務向委托方實際收取的報酬。 　　《國家稅務總局關于代理業(yè)營業(yè)稅計稅依據(jù)確定問題的批復》（國稅函﹝2007﹞908號）文件規(guī)定：“納稅人從事代理業(yè)務，應以其向委托人收取的全部價款和價外費用減除現(xiàn)行稅收政策規(guī)定的可扣除部分的余額為計稅營業(yè)額，納稅人從事代理業(yè)務，應憑以下憑證作為差額征收營業(yè)稅的扣除憑證，營業(yè)額減除項目發(fā)生在境內(nèi)的，該減除項目支付款項憑證必須是發(fā)票或其他合法有效憑證，支付給境外的，該減除項目支付款項憑證必須是外匯付匯憑證、外方公司的簽收單據(jù)或出具的公證證明?！?/div>