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是的，公司取得的房租專用發(fā)票可以抵扣增值稅款。根據(jù)《中華人民共和國(guó)增值稅暫行條例》第十二條第二款規(guī)定：“發(fā)票應(yīng)當(dāng)記載完整的增值稅稅款項(xiàng)目，并記載下列相關(guān)金額：（2）可以抵扣的應(yīng)納稅額?！狈孔鈱Ｓ冒l(fā)票就是一種發(fā)票，所以它可以用于抵扣增值稅款。 此外，在申報(bào)增值稅時(shí)，允許申報(bào)方根據(jù)付款憑證(如此處的房租專用發(fā)票)對(duì)購(gòu)買的實(shí)物貨物或者接受的勞務(wù)進(jìn)行抵扣，申報(bào)抵扣的數(shù)額不得超過實(shí)際購(gòu)買的或者接受的數(shù)額，以避免增值稅被濫用。 總之，在持有房租專用發(fā)票并證明其合法性的情況下，公司可以在申報(bào)增值稅時(shí)，利用其作為付款憑證，將其抵扣增值稅款。