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2009年6月1日，財政部發(fā)布了《關(guān)于印發(fā)企業(yè)會計準則解釋第3號的通知》（財會[2009]8號）對搬遷補償支出的會計處理又進行了進一步明確規(guī)定，企業(yè)因城鎮(zhèn)整體規(guī)劃、庫區(qū)建設(shè)、棚戶區(qū)改造、沉陷區(qū)治理等公共利益進行搬遷，收到政府從財政預算直接撥付的搬遷補償款，應作為專項應付款處理。其中，屬于對企業(yè)在搬遷和重建過程中發(fā)生的固定資產(chǎn)和無形資產(chǎn)損失，有關(guān)費用性支出、停工損失及搬遷后擬新建資產(chǎn)進行補償?shù)模瑧詫ｍ棏犊钷D(zhuǎn)入遞延收益，并按照《企業(yè)會計準則第16號——政府補助》進行會計處理。企業(yè)取得的搬遷補償款扣除轉(zhuǎn)入遞延收益的金額后如有結(jié)余的，應當作為資本公積處理。 《國家稅務總局關(guān)于企業(yè)政策性搬遷或處置收入有關(guān)企業(yè)所得稅處理問題的通知＞（國稅函[2009]118號）文規(guī)定，企業(yè)從規(guī)劃搬遷次年起的五年內(nèi)，其取得的搬遷收入或處置收入暫不計入企業(yè)當年應納稅所得額，在五年期內(nèi)完成搬遷的，企業(yè)搬遷或處置收入扣除固定資產(chǎn)重置或改良支出、技術(shù)改造支出和職工安置支出后的余額，計入企業(yè)應納稅所得額。從該文可知，對于企業(yè)收到的政府搬遷補助，企業(yè)雖然按會計準則分期計入當期損益，但是在稅務處理上，只有在搬遷結(jié)束后，才會計算搬遷補償款與搬遷支出的凈額繳納企業(yè)所得稅，企業(yè)財務人員在年度所得稅匯算清繳時應把按會計準則分期計入當期損益的搬遷補助從當期應納稅所得額中扣減，即確認搬遷補償款的永久性差異，這同其他政府補助有著根本性區(qū)別。 另外，國稅函[2009]118號文規(guī)定，企業(yè)利用政策性搬遷或處置收人購置或改良的固定資產(chǎn)，可以按照現(xiàn)行稅收規(guī)定計算折舊或攤銷，并在企業(yè)所得稅稅前扣除，這項文件同財稅[2009]87號）是有根本性區(qū)別。財稅[2009]87號）強調(diào)企業(yè)的不征稅收入用于支出所形成的資產(chǎn)，其計算的折舊、攤銷不得在計算應納稅所得額時扣除，因此，企業(yè)財務人員在實際工作中要把握兩者的區(qū)別。