現(xiàn)在不少小規(guī)模企業(yè)向一般納稅人銷售貨物時，往往忽視了到主管稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票。根據(jù)國家稅務(wù)總局《關(guān)于修訂〈增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定〉的通知》（國稅發(fā)〔2006〕156號）的規(guī)定，增值稅小規(guī)模納稅人需要開具專用發(fā)票的，可向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請代開。因此單位向一般納稅人銷售貨物完全可以到稅務(wù)機(jī)關(guān)申請代開增值稅專用發(fā)票。這樣，一般納稅人的購貨單位取得代開專用發(fā)票可以抵扣進(jìn)項稅，降低購貨成本，公司也可以擴(kuò)大產(chǎn)品銷路。申請代開增值稅專用發(fā)票的具體做法是：
一、申請代開專用發(fā)票的范圍
國家稅務(wù)總局《關(guān)于印發(fā)〈稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票管理辦法（試行）〉的通知》（國稅發(fā)〔2004〕153號）規(guī)定，已辦理稅務(wù)登記的小規(guī)模納稅人（包括個體經(jīng)營者），以及國家稅務(wù)總局確定的其他可予代開增值稅專用發(fā)票的納稅人，可以申請代開專用發(fā)票。
但主管稅務(wù)機(jī)關(guān)只能為所轄范圍內(nèi)的增值稅納稅人代開專用發(fā)票。固定業(yè)戶到外縣（市）銷售貨物，向其機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報納稅，需要申請代開專用發(fā)票的，也應(yīng)到其機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請代開。
國家稅務(wù)總局《關(guān)于調(diào)整憑普通發(fā)票退稅政策的通知》（國稅函〔2005〕248號）規(guī)定，凡出口企業(yè)從小規(guī)模納稅人購進(jìn)的貨物出口，一律憑增值稅專用發(fā)票（必須是增值稅防偽稅控開票系統(tǒng)或防偽稅控代開票系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票）及有關(guān)憑證辦理退稅。小規(guī)模納稅人向出口企業(yè)銷售這些產(chǎn)品，可到稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票。
但應(yīng)注意下列兩種情況不得申請代開增值稅專用發(fā)票：國家稅務(wù)總局《關(guān)于增值稅起征點調(diào)整后有關(guān)問題的批復(fù)》（國稅函〔2003〕1396號）規(guī)定，銷售額未達(dá)到起征點的個體工商業(yè)戶，稅務(wù)機(jī)關(guān)不得為其代開專用發(fā)票；《國家稅務(wù)總局關(guān)于修訂<稅專用發(fā)票使用規(guī)定>通知》（國稅發(fā)〔2006〕156號文件）規(guī)定，銷售免稅貨物不得開具專用發(fā)票，法律、法規(guī)及國家稅務(wù)總局另有規(guī)定的除外。
二、申請代開專用發(fā)票的程序
為了貫徹《行政許可法》，根據(jù)《國務(wù)院關(guān)于第三批取消和調(diào)整行政審批項目的決定》（國辦發(fā)〔2004〕16號）文件及國家稅務(wù)總局《關(guān)于取消小規(guī)模企業(yè)銷售貨物或應(yīng)稅勞務(wù)由稅務(wù)所代開增值稅專用發(fā)票審批后有關(guān)問題的通知》（國稅函〔2004〕895號）規(guī)定，納稅人申請代開專用發(fā)票，不再由稅務(wù)機(jī)關(guān)審批。
根據(jù)國家稅務(wù)總局《關(guān)于印發(fā)〈稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票管理辦法（試行）〉的通知》（國稅發(fā)〔2004〕153號）規(guī)定，納稅人應(yīng)按下列程序申請代開專用發(fā)票：
�。ㄒ唬┨顚憽洞_增值稅專用發(fā)票繳納稅款申報單》，連同稅務(wù)登記證副本，到主管稅務(wù)機(jī)關(guān)稅款征收崗位按專用發(fā)票上注明的稅額全額申報繳納稅款，同時繳納專用發(fā)票工本費。
�。ǘ├U納稅款后，憑《申報單》和稅收完稅憑證及稅務(wù)登記證副本，到代開專用發(fā)票崗位申請代開專用發(fā)票。
�。ㄈ┒悇�(wù)機(jī)關(guān)通過防偽稅控系統(tǒng)代開增值稅專用發(fā)票。
具體應(yīng)提交的材料以主管稅務(wù)機(jī)關(guān)要求的為準(zhǔn)。
據(jù)了解，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)一般還要求申請代開增值稅專用發(fā)票的納稅人提供購銷合同復(fù)印件和購貨方加蓋“增值稅一般納稅人”確認(rèn)專章的稅務(wù)登記證副本復(fù)印件。
代開專用發(fā)票崗確認(rèn)申報征收崗傳來的征稅電子信息與申報單和稅收完稅證上的金額、稅額相符合，按照申報單、完稅證和專用發(fā)票一一對應(yīng)即“一單一證一票”原則，為增值稅納稅人代開增值稅專用發(fā)票。
專用發(fā)票的“單價”欄和“金額”欄分別填寫不含增值稅稅額的單價和銷售額；“稅率”欄填寫增值稅征收率，即3%。
三、代開專用發(fā)票的抵扣
根據(jù)國家稅務(wù)總局《關(guān)于加強(qiáng)稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票管理問題的通知》（國稅函〔2004〕1404號）規(guī)定，增值稅一般納稅人取得的稅務(wù)機(jī)關(guān)通過防偽稅控系統(tǒng)代開的增值稅專用發(fā)票，同取得其他增值稅專用發(fā)票一樣，必須自該專用發(fā)票開具之日起180日內(nèi)認(rèn)證，并在認(rèn)證通過的當(dāng)月按規(guī)定核算當(dāng)期進(jìn)項稅額并申報抵扣。不必填報代開發(fā)票抵扣清單�？梢缘挚鄣倪M(jìn)項稅額以代開專用發(fā)票上注明的、按征收率計算的稅額為準(zhǔn)。
四、發(fā)生銷貨退回或銷售折讓等情況的處理
�。ㄒ唬┒悇�(wù)機(jī)關(guān)代開專用發(fā)票時填寫有誤的，應(yīng)及時在防偽稅控代開票系統(tǒng)中作廢，重新開具。
（二）代開專用發(fā)票后發(fā)生退票的，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)按照增值稅一般納稅人作廢或開具負(fù)數(shù)專用發(fā)票的有關(guān)規(guī)定進(jìn)行處理。
�。ㄈ┬枰匦麻_票的，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)同時進(jìn)行新開票稅額與原開票稅額的清算，多退少補(bǔ)；對無需重新開票的，按有關(guān)規(guī)定退還增值稅納稅人已繳的稅款或抵頂下期正常申報稅款。根據(jù)國家稅務(wù)總局《關(guān)于國家稅務(wù)局為小規(guī)模納稅人代開發(fā)票及稅款征收有關(guān)問題的通知》（國稅發(fā)〔2005〕18號）規(guī)定，由主管地稅局退還已征收的城市維護(hù)建設(shè)稅和教育費附加或者委托主管國稅局在下期抵繳已征收的城市維護(hù)建設(shè)稅和教育費附加。
五、雙定戶申請代開發(fā)票如何征稅
國家稅務(wù)總局《關(guān)于加強(qiáng)稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票管理問題的通知》（國稅函〔2004〕1404號）規(guī)定，對實行定期定額征收方法的納稅人正常申報時，按以下方法進(jìn)行清算：
�。ㄒ唬┟吭麻_票金額大于應(yīng)征增值稅稅額的，以開票金額數(shù)為依據(jù)征收稅款，并作為下一年度核定定期定額的依據(jù)。
（二）每月開票金額小于應(yīng)征增值稅稅額的，按應(yīng)征增值稅稅額數(shù)征收稅款。