在納稅人中，存在著一種較為普遍的現(xiàn)象，即每當新稅政出臺時，一些納稅人往往會從所謂納稅籌劃的角度對新稅政做出有利于自身的解釋，而這種一廂情愿的解釋很可能帶有嚴重的偏頗甚至錯誤。所以，要正確理解和執(zhí)行新稅政，納稅人不僅要從獨立、客觀的角度去學習它，還要及時主動向有關稅務機關咨詢，避免出現(xiàn)不必要的錯誤。
在某稅務檢查組去甲房地產(chǎn)開發(fā)公司例行檢查2008年度的匯算清繳時，預收賬款核算的準確性和計繳稅額的正確性成了此次檢查的重點。
甲公司財務部按照預收賬款預繳企業(yè)所得稅的計算過程是：先核實并確定2008年末的預收賬款余額；然后，按照國稅發(fā)[2009]31號文的規(guī)定確定預計計稅毛利率為10%；再按照預收賬款年末余額和10%的預計計稅毛利率計算當年度預計計稅毛利額；將計算的計稅毛利額扣除相關期間費用、營業(yè)稅金及附加后再并入當期應納稅所得額；計算年末預收賬款應補繳的企業(yè)所得稅（減除當年度前三個季度按預收賬款預繳的所得稅）。該公司財務人員解釋說，他們是在認真學習文件并咨詢了稅務顧問后才決定這樣操作的。
盡管檢查人員對第三點、第四點和第五點提出了疑問，但甲公司財務人員卻拿出國稅發(fā)[2006]31號文解釋說，該文雖已廢止，但國稅發(fā)[2009]31號文未能明確的內容可以并應該借鑒國稅發(fā)[2006]31號文的相關規(guī)定。如國稅發(fā)[2006]31號文的第一條就明確規(guī)定：預售收入先按預計計稅毛利率分季（或月）計算出當期毛利額，扣除相關的期間費用、營業(yè)稅金及附加后再計入當期應納稅所得額。而且，國稅發(fā)[2009]31號文對稅金扣除問題未能明確，同時，對是否按照國稅發(fā)[2009]31號文規(guī)定的預計計稅毛利率調整此前已經(jīng)預繳的企業(yè)所得稅的問題，也未能明確。因此，稅務機關不能隨便做出不利于納稅人的解釋。
雖然甲公司財務人員的解釋聽上去很有道理，但檢查小組經(jīng)討論后認為，其計算過程存在兩大錯誤：
一是在國稅發(fā)[2009]31號文印發(fā)前，對甲公司已經(jīng)按照國稅函[2008〕]299號文規(guī)定的“預計利潤 率”（15%）計算并預繳的企業(yè)所得稅，在本次匯算清繳時，不應按照國稅發(fā)[2009]31號文規(guī)定的“預計計稅毛利率”（10%）重新計算。因為國稅發(fā)[2009]31號文規(guī)定的“預計計稅毛利率”（10%）只適用于該文印發(fā)后申報預收賬款而預繳的企業(yè)所得稅，只有待相關開發(fā)產(chǎn)品完工、結算計稅成本后按照實際利潤再行調整。
二是按照國稅發(fā)[2009]31號文第十二條的規(guī)定：企業(yè)發(fā)生的期間費用、已銷開發(fā)產(chǎn)品計稅成本、營業(yè)稅金及附加、土地增值稅準予當期按規(guī)定扣除。所以，對未完工開發(fā)產(chǎn)品取得的預收賬款按規(guī)定計算的預計毛利額可以扣除發(fā)生的期間費用（實際上期間費用也無法在已銷和未銷開發(fā)產(chǎn)品之間劃分清楚），但不可以扣除相關的營業(yè)稅金、附加及土地增值稅。
針對甲公司財務人員提出的“國稅發(fā)[2006]31號文第一條允許毛利額扣除相關期間費用、營業(yè)稅金及附加后再計入當期應納稅所得額，為什么國稅發(fā)[2009]31號文就不允許”的疑問，檢查小組表示，對于開發(fā)項目位于其他地區(qū)的，國稅發(fā)[2009]31號文已經(jīng)將原來10%的預計利潤率調低為5%的計稅毛利率，如果再允許扣除相關的營業(yè)稅金及附加，僅扣除5%的營業(yè)稅后其計稅所得額就將變?yōu)榱�，再扣除附加及土地增值稅就變成了負�?shù)，自然不可能執(zhí)行。
實際上，國稅發(fā)[2009]31號文第九條僅是規(guī)定了“企業(yè)銷售未完工開發(fā)產(chǎn)品取得的收入，應先按預計計稅毛利率分季（或月）計算出預計毛利額，計入當期應納稅所得額”。其并未在此基礎上規(guī)定，再扣除后面第十二條的“計稅成本、營業(yè)稅金及附加、土地增值稅”三項內容。從該文件還可看出，第十二條允許扣除的范圍也僅是指“已銷開發(fā)產(chǎn)品”，即“銷售的已完工的開發(fā)產(chǎn)品”（因為沒有完工的開發(fā)產(chǎn)品根本無法結轉相關的“計稅成本”）。
如果僅允許扣除后面的兩項“營業(yè)稅金及附加、土地增值稅”，為什么不可扣除前面第一項“計稅成本”呢？因為國稅發(fā)[2009]31號文根本就沒有規(guī)定對未完工開發(fā)產(chǎn)品取得的收入按照預計毛利額預征企業(yè)所得稅后可以再扣除“計稅成本、營業(yè)稅金及附加、土地增值稅”。實際上，測算預計毛利額時就已經(jīng)扣除了“計稅成本”。
至此，甲公司財務人員終于認同了檢查小組的觀點。