回顧我國出口退稅發(fā)展歷史，出口企業(yè)申請退稅的憑證幾經(jīng)變化，隨著出口退稅政策的完善而逐步規(guī)范。
下面簡要介紹近年來外貿(mào)企業(yè)申請辦理出口退稅的憑證。
一、1950年
1950年國家頒布的《貨物稅暫行條例》規(guī)定：已稅貨物輸出國外，經(jīng)公告準(zhǔn)予退稅者，由出口商向稅務(wù)機(jī)關(guān)申請退還貨物稅稅款。指對出口無利的產(chǎn)品實(shí)行退稅。分為三種方法處理：
一是退還全部稅款：如鞭炮、焚化品、罐頭、搪瓷、玻璃制品等；
二是退還1/2稅款：如化妝品、香皂、牙膏、暖水瓶等；
三是退還原料全部稅款：如紙花、毛織品、絲綢等；
屬于退稅范圍出口產(chǎn)品的出口商，應(yīng)于出口之日起3個(gè)月內(nèi)，持原定稅照或分運(yùn)照（即產(chǎn)品原來的納稅證明）、海關(guān)出口證明和提貨單副本等憑證，送出口地稅務(wù)部門核對相符后，填發(fā)《收入退還書》，交由出口商向指定金庫領(lǐng)取應(yīng)退稅款。
二、1966年
為了扭轉(zhuǎn)出口虧損局面，外貿(mào)部請示國務(wù)院對出口產(chǎn)品以“補(bǔ)貼”的形式實(shí)行退稅，退稅率按照工商統(tǒng)一稅產(chǎn)品的平均稅負(fù)確定綜合退稅率8%，即出口產(chǎn)品按照出口金額和8%的綜合退稅率計(jì)算應(yīng)退稅額。出口商所持退稅憑證為：產(chǎn)品原來的納稅證明、海關(guān)出口證明和提貨單副本等憑證，由財(cái)政部統(tǒng)一退付給外貿(mào)部。
三、1980年
1980年規(guī)定對國內(nèi)企業(yè)和單位的進(jìn)口產(chǎn)品征稅，對出口產(chǎn)品根據(jù)出口換匯成本的高低，視其虧損程度，在保本微利的原則下酌情給予減免稅。
四、1983年
1983年9月1日起對一切單位進(jìn)口的鐘、表、自行車、縫紉機(jī)、照相機(jī)、電風(fēng)扇、洗衣機(jī)、電冰箱、收音機(jī)、收錄機(jī)、錄像機(jī)、電視機(jī)、袖珍電子計(jì)算器、空調(diào)機(jī)、金筆、依金筆、圓珠筆等17種產(chǎn)品征收進(jìn)口環(huán)節(jié)工商稅或增值稅。進(jìn)口稅款組成計(jì)稅價(jià)格計(jì)算，由海關(guān)在征收關(guān)稅時(shí)代征，所征稅款直接就地繳入中央金庫。對外貿(mào)企業(yè)、工貿(mào)公司和工業(yè)企業(yè)出口的上述17種產(chǎn)品，一律退還（免征）生產(chǎn)環(huán)節(jié)的增值稅或最后生產(chǎn)環(huán)節(jié)的工商稅。退、免稅必須由出口單位持已繳納的最后環(huán)節(jié)的工商稅收證明、海關(guān)出口證明向本單位所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)提出申請，經(jīng)審查核實(shí)后，將稅款退給出口單位。
五、1985年
為大力促進(jìn)出口貿(mào)易發(fā)展，簡化出口退稅手續(xù)，對出口產(chǎn)品退產(chǎn)品稅或增值稅改進(jìn)和補(bǔ)充明確規(guī)定：外貿(mào)企業(yè)自營出口的產(chǎn)品根據(jù)“出口商品銷售明細(xì)帳”填報(bào)《出口產(chǎn)品退（免）稅申請表》向稅務(wù)機(jī)關(guān)申請辦理出口退（免）稅；其他企業(yè)委托外貿(mào)企業(yè)出口的和工業(yè)企業(yè)直接出口的產(chǎn)品，還要附送發(fā)票（副本或影印件）和報(bào)關(guān)單，以資稅務(wù)機(jī)關(guān)審核。工業(yè)企業(yè)或代理出口的單位出口產(chǎn)品如需要申請退稅，報(bào)關(guān)單應(yīng)增填一份“出口貨物報(bào)關(guān)單”向海關(guān)申請證明確系出口，由海關(guān)加蓋出口印章后退還申請單位，作為工業(yè)企業(yè)或委托單位辦理退（免）稅的憑證。
對中央、地方外貿(mào)企業(yè)和工業(yè)主管部門及工業(yè)企業(yè)經(jīng)營出口的產(chǎn)品，除原油和成品油外，在出口后一律退（免）產(chǎn)品稅或增值稅，屬于增值稅范圍的產(chǎn)品退（免）各生產(chǎn)環(huán)節(jié)已納的增值稅；屬于產(chǎn)品稅范圍的產(chǎn)品，退（免）最后生產(chǎn)環(huán)節(jié)已納的產(chǎn)品稅。對出口產(chǎn)品的退稅款，中央企業(yè)退中央庫，地方企業(yè)退地方庫。
六、1994年
1993年底國務(wù)院通過了《增值稅暫行條例》規(guī)定：納稅人出口適用稅率為零的貨物，向海關(guān)辦理出口手續(xù)后，憑出口貨物報(bào)關(guān)單等憑證申請辦理出口退稅。
1994年根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例》和《中華人民共和國消費(fèi)稅暫行條例》的有關(guān)規(guī)定制定了《出口貨物退（免）稅管理辦法》（國稅發(fā)1994年 [031]號(hào)），明確規(guī)定：有進(jìn)出口經(jīng)營權(quán)的企業(yè)出口和代理出口的貨物，除另有規(guī)定者外，可在貨物報(bào)關(guān)并在財(cái)務(wù)上做銷售后，憑出口貨物報(bào)關(guān)單、購進(jìn)貨物的增值稅專用發(fā)票（稅款抵扣聯(lián)）或普通發(fā)票、申請退消費(fèi)稅產(chǎn)品的還應(yīng)提供《出口貨物消費(fèi)稅專用繳款書》（以下簡稱“專用稅票”或分割單）、出口收匯核銷單、出口發(fā)票等有關(guān)憑證，可以按月向稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)辦理該項(xiàng)出口貨物的退稅。
七、1996年
為進(jìn)一步加強(qiáng)出口退稅管理，防范騙取出口退稅行為的發(fā)生，從1996年4月1日起，凡出口企業(yè)申請辦理出口退稅時(shí)，在提供出口貨物報(bào)關(guān)單、購進(jìn)貨物的增值稅專用發(fā)票（稅款抵扣聯(lián)）或普通發(fā)票、出口貨物銷售明細(xì)賬和出口收核銷單的同時(shí)，必須附送《稅收（出口貨物專用）繳款書》（簡稱“專用稅票”）或《出口貨物完稅分割單》（簡稱“分割單”）。為了辨別專用稅票的真?zhèn)�，國家稅�?wù)總局建立了出口退稅專用稅票認(rèn)證系統(tǒng)，對系統(tǒng)中提供的專用稅票電子信息與出口企業(yè)申報(bào)的紙制憑證核對無誤后辦理出口退稅。期間進(jìn)貨憑證的主要審核憑證為“專用稅票”。
八、2003年
自2003年8月1日起（以開票日期為準(zhǔn)）辦理出口退稅取得的增值稅專用發(fā)票必須90日內(nèi)認(rèn)證，未經(jīng)過認(rèn)證或認(rèn)證未通過的一律不予辦理出口退稅（國稅發(fā) [2003]133號(hào)）。退稅機(jī)關(guān)在審核中應(yīng)與專用發(fā)票電子信息進(jìn)行比對，比對無誤的方可按現(xiàn)行出口退稅規(guī)定辦理退稅。發(fā)現(xiàn)出口企業(yè)提供的專用發(fā)票屬于協(xié)查有誤發(fā)票的，一律不予退稅。期間增值稅專用發(fā)票和專用稅票信息同時(shí)審核，審核進(jìn)貨憑證逐步從審核專用稅票為主轉(zhuǎn)為審核增值稅專用發(fā)票為主。
九、2004年
外貿(mào)企業(yè)向其主管退稅機(jī)關(guān)申報(bào)辦理2004年1月1日以后報(bào)關(guān)出口的貨物的退稅時(shí)，提供增值稅專用發(fā)票（或普通發(fā)票）、出口貨物報(bào)關(guān)單、出口收核銷單、出口發(fā)票（不作為主要憑證）等憑證，期間審核以增值稅專用發(fā)票內(nèi)容為主的進(jìn)貨憑證數(shù)據(jù)，不再錄入增值稅《稅收（出口貨物專用）繳款書》或《出口貨物完稅分割單》。退稅機(jī)關(guān)在審核退稅時(shí)，使用增值稅專用發(fā)票認(rèn)證信息審核辦理出口退稅。凡外貿(mào)企業(yè)提供2003年8月1日（以開票日期為準(zhǔn)）以前開具的增值稅專用發(fā)票或普通發(fā)票，仍審核專用稅票信息后方可辦理退稅。
2004年6月1日以后報(bào)關(guān)出口（以出口報(bào)關(guān)單上注明的出口日期為準(zhǔn)，下同）的貨物，凡增值稅專用發(fā)票是在2004年6月1日以后開具的，出口企業(yè)在申請辦理出口退稅時(shí)，免予提供增值稅專用稅票。出口企業(yè)從小規(guī)模納稅人購進(jìn)的貨物和出口消費(fèi)稅產(chǎn)品的貨物，其出口退稅仍實(shí)行專用稅票管理，期間取消了一般納稅人購進(jìn)貨物申請退稅的專用稅票憑證。
十、2005年
2005年外貿(mào)企業(yè)申請出口退稅時(shí)提供增值稅專用發(fā)票（普通發(fā)票和消費(fèi)稅專用稅票）、出口貨物報(bào)關(guān)單、出口收核銷單等有關(guān)憑證辦理退稅。出口企業(yè)從小規(guī)模納稅人購進(jìn)的貨物自2005年4月1日起出口后申請退稅一律憑增值稅專用發(fā)票（必須是增值稅防偽稅控開票系統(tǒng)或防偽稅控代開票系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，下同）期間退稅憑證取消了從小規(guī)模納稅人購進(jìn)的貨物的專用稅票。至此增值稅專用稅票作為出口退稅憑證已成為歷史。