會計電算化的實施，大大提高了會計信息處理的速度和準確性，能為用戶提供及時、準確的會計信息，是會計事業(yè)發(fā)展史上一次史無前例的飛躍。但在這個飛躍也給審計工作帶來很大的影響，歸納起來主要有下列幾方面：
　　
　　一、審計線索的改變
　　
　　由于會計實行電算化，使審計線索發(fā)生很大變化，傳統(tǒng)的手工會計系統(tǒng)中的審計線索在電算化系統(tǒng)中將會中斷甚至消失。在手工系統(tǒng)中，由原始憑證到記賬憑證，由過賬到財務報表的編制，每一步都有文字記錄，都有經手人簽字，審計線索十分清楚。審計人員進行審行，完全可以根據需要進行順查、逆查或抽查。但在電算化會計系統(tǒng)中，傳統(tǒng)的賬薄沒有了，絕大部分的文字記錄消失了，代之的是存有會計資料的磁盤和磁帶，這些磁性介質上的信息是以機器可讀的形式存在的，肉眼不能識別。此外，從原始數(shù)據進入計算機，到財務報表的輸出，這中間的全部會計處理集中由計算機按程序指令自動守成，傳統(tǒng)的審計線索在這里中斷了、消失了。傳統(tǒng)的查賬方法，對電算化的會計個體已不完全適用。為了能有效地審計電算化的會計個體，在電算化會計系統(tǒng)的設計和開發(fā)時必須注意審計需求，要留下新的審計線索。例如，要留下每筆經濟業(yè)務的詳細記錄，而不能只留下更新后的當前余額。有些系統(tǒng)中的暫存文件，經過一定的時間就要被刪掉。如果審計需要查這些文件，則應拷貝，以便查尋。
　　
　　二、會計系統(tǒng)內部控制的改變
　　
　　國際上近代的審計都是以系統(tǒng)為基礎的，即審計師要對會計系統(tǒng)的內部控制進行審查和評價，以作為制定審計方案和決定抽查范圍的依據。由于會計系統(tǒng)實現(xiàn)了電算化，手工會計系統(tǒng)原有的內容控制已不能適應電子數(shù)據處理的新特點，不能有效地降低電算化會計系統(tǒng)特有的風險。例如，在電算化會計系統(tǒng)中，會計信息的處理和存貯高度集中于計算機，會使手工會計系統(tǒng)中的某些職責分離，互相寄制的控制失效。為了系統(tǒng)的安全可靠和系統(tǒng)處理與存貯的會計信息準確完整，必須考慮電算化系統(tǒng)的特點，針對其固有的風險，建立新的內部控制。這些內部控制除了有關電子數(shù)據處理的制度、規(guī)定和人工執(zhí)行的程序控制外，內部控制的程序化是電算化會計信息系統(tǒng)的一個重要特點。如何識別、研究、審查和評價這些新的內容控制，尤其是程序化的內部控制，是會計電算化給審計提出的又一個新問題。美國注冊會計師協(xié)會發(fā)表的第3號審計準則概論指出："如果客戶在其會計系統(tǒng)中使用了電子數(shù)據處理，無論應用是簡單的帶是復雜的，審計員都要充分地了解整個系統(tǒng)， 使得能識別和評價系統(tǒng)的基本會計控制的特點。在包括較復雜的電子數(shù)據處理應用的情況下，審計員在執(zhí)行必要的審計方案中將要就應用專業(yè)化的電子數(shù)據處理的專門知識"。在會計電算化條件下，由于內部控制變化了，審計人員必然研究電算化系統(tǒng)的內部控制，掌握其審查方法。對程序控制，審計員要利用計算機輔助審計技術進行審計。對于電算化會計信息系統(tǒng)內部控制的弱點，審計人員要能評估其影響，并向被審單位提出改進的建議。
　　
　　三、審計內容的改變
　　
　　在會計電算化條件下，審讓的監(jiān)督職能雖然沒有改變，但審計內容卻發(fā)生了變化。在電算化會計信息系統(tǒng)中，會計事項由計算機按程序自動進行處理，如果系統(tǒng)的應用程序出錯或被非法篡改，則計算機只會按給定的程序以同樣錯誤的方法處理所有的有關會計事項，系統(tǒng)就可能被不知，鬼不覺地嵌入非法的舞弊程序，不法分子可以利用這些舞弊程序大量侵吞企業(yè)的財物。系統(tǒng)的處理是否合規(guī)、合法、安全可靠，都與計算機系統(tǒng)的處理和控制功能有直接關系。電算化會計信息系統(tǒng)的特點，及其固有的風險，決定了審計的內容要增加對計算機系統(tǒng)處理和控制功能的審查。在會計電算化條件下，審計人員要花費較多的時間和精力來了解和審查計算機系統(tǒng)的功能，以證實其處理的合法性、正確性和完整性，保證系統(tǒng)的安全可靠。 

　　當一個系統(tǒng)已經完成并投用后，再對它進行改進，比在系統(tǒng)設計、開發(fā)階段進行困難得多，費用昂貴得多。因此，除要對投用后的電算化會計信息系統(tǒng)進行事后審計處，還應提倡在系統(tǒng)的設計、開發(fā)階段，應有審計人員參與進行事前和事中的審計。他們在系統(tǒng)設計開發(fā)的各個階段要注意審查和考核下列問題：一是系統(tǒng)的功能是否恰當、完備、能否滿足用戶核算和管理的要求；二是系統(tǒng)的數(shù)據流程、處理方法是符合會計制度、法規(guī)、法令和財經紀律的要求；三是系統(tǒng)是否建立了恰當?shù)某绦蚩刂?，以防止或及時發(fā)現(xiàn)無意的差錯或有意的舞弊；四是系統(tǒng)是否保留了充分的審計線索，能否為日后順利開發(fā)審計提供必需的條件；五是系統(tǒng)的安全保密措施和管理制度是否健全，能否為系統(tǒng)日后安全可靠地運行系統(tǒng)的開發(fā)控制。審計人員還參與系統(tǒng)的調試、檢測和驗收，盡可能及時地發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)的問題，及時提出改進意見。

　　四、審計技術的改變

　　在手工會計處理的條件下，審計可根據具體情況進行順查、逆查或抽查。審查一般采用審閱、核對、分析、比較、調查和證實等方法。所有審查工作都是由人工完成的。在會計電算化條件下，會計的特點決定了審計的內容和技術的改變。雖然人工的各種審查技術仍是很重要的，但計算機輔助審計是必不可少的審計技術。

　　信息處理的電算化和信息存貯的電磁化，如果沒有全部打印輸出紙質的賬表文件，磁性介質上的會計資料是肉眼所不能識別的，審計人員只能利用計算機對它進行審查。即使系統(tǒng)的全部賬表都要硬拷貝，利用計算機比手工可以更迅速、更有效地完成審閱、核對、分析、比較等各項審查工作。例如，計算機可以幫助審計人員審閱賬務文件，找出滿足指定條件的會計記錄；可以對眾多的會計事項進行統(tǒng)計抽樣，以便審計員對缺抽出樣本進一步審查；還可以根據系統(tǒng)所記錄的會計資料計算出各種財務比率、變化率和進行各種分析比較等等。
 
　　在會計電算化條件下，既要對計算機系統(tǒng)的處理和控制功能進行審查，又要采用計算機輔助審計技術。對計算機系統(tǒng)功能的審查，必須運行計算機，讓計算機執(zhí)行各種操作和處理，也就是利用計算機開展審計。此項審查是不能離開計算機僅由人工來完成的。 

　　另一個計算機輔助審計技術的應用是，在電算化會計信息系統(tǒng)的設計開發(fā)過程中，可事先在被審計的計算機系統(tǒng)中的嵌入審計程序。這些程序可以執(zhí)行審計監(jiān)督，建立審計跟蹤文件，記錄符合指定條件的會計事項及其操作處理的有關信息，以便日后審計人員踴躍追查。這些程序還可以執(zhí)行一些特殊的審計功能。

　　五、對審計人員的要求更高

　　在會計電算化條件下，由于審計線索內容控制、內容和審計技術的改變，決定了對審計人員的要求高了。不懂得計算機的審計人員，因審計線索的改變而無法踴躍審計；不懂得電算化會計系統(tǒng)的特點和風險而不能識別和審其內部控制；不懂得使有計算機而無法對計算機進行審查或利用計算機進行審計。因此，要求審計人員不僅要有會計、審計理論和實務知識，而且要掌握計算機和電算化會計方面的知識和技能。
 
　　由上述可見，會計電算化給審計提出了許多新問題、新要求。傳統(tǒng)的手工審計已不能適應電算化的要求。學習、研究和開展計算機審計是審計部門和審計人員的新課題和新任務。