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是的，在公司注銷的情況下，應付款的余額將被視為企業(yè)收入，由稅務局監(jiān)管，計算其應納稅額，并由公司向稅務局支付。根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》，稅收機關按照稅率預先估算企業(yè)全年應納稅額，按月收稅。例如，某公司在關閉時擁有一定金額的余額，其月應納稅額可由稅務機關按照單位所得稅定期繳付比例計算得出。 此外，《關于公司注銷后企業(yè)所得稅征收辦法（試行）》明確了公司注銷后企業(yè)所得稅的征收辦法，包括：（1）企業(yè)報告稅收登記信息。（2）稅收機關核算企業(yè)最后一個財務期的應納稅額，核定企業(yè)應收的企業(yè)所得稅。（3）報還此前發(fā)生的一般納稅義務。（4）報送最后一個財務期企業(yè)所得稅收入和支出。 總之，企業(yè)應付款余額屬于企業(yè)收入，應被收稅。稅務部門會按照相關法規(guī)收取和監(jiān)管企業(yè)所得稅，嚴格執(zhí)行稅法，保證企業(yè)按期繳納稅款，健全企業(yè)稅收管理制度，促進社會經(jīng)濟健康發(fā)展。