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是的，如果農(nóng)民代開發(fā)票給公司，賠償款可以免稅。但是，在給農(nóng)民開具發(fā)票之前，需要先確認(rèn)該賠償款已經(jīng)成為農(nóng)民的收入，即該農(nóng)民已經(jīng)完全擁有賠償款的所有權(quán)利。這是因為，根據(jù)《中華人民共和國稅收征收管理法》，收入只有當(dāng)取得者實際擁有此收入時，該收入才可被認(rèn)定為取得者應(yīng)稅收入，也就是所謂的稅務(wù)合規(guī)性。另外，如果農(nóng)民可以提供足夠的證據(jù)，證明賠償款已經(jīng)入賬，公司也可以向中國稅務(wù)機(jī)關(guān)申請不征收個人所得稅。 拓展知識：根據(jù)稅收法規(guī)，取得者從第三方獲得的收入應(yīng)按照征稅比例繳納個人所得稅，其中包括從企業(yè)收到的補償、賠償金。但是，有些特殊情況下，收入不需要繳納個人所得稅，比如從政府辦事機(jī)構(gòu)獲得的補償金、賠償金等。