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針對未開發(fā)票在稅控系統(tǒng)作廢以后，紙質發(fā)票處理的問題，要根據(jù)發(fā)票的使用情況處理，通常有以下幾種處理方式： 1. 若紙質發(fā)票未使用，可以按照稅控系統(tǒng)申請作廢手續(xù)，需要將紙質發(fā)票交回稅務機關，由稅務機關統(tǒng)一進行銷毀或做其他處理。 2. 若紙質發(fā)票已對外使用，發(fā)票的據(jù)實使用情況應在具體的稅收情況下詳細說明，并將有關發(fā)票提交至稅務機關。由稅務機關根據(jù)使用情況進行判斷，并依據(jù)實際情況作出處理。 3. 如果發(fā)票有疑義，可以參考《發(fā)票管理辦法》等相關文件，對發(fā)票情況進行分析總結，并對紙質發(fā)票作出處理。 拓展知識：在發(fā)票處理中，可以分為稅收管理和發(fā)票管理兩種，稅收管理又可分為稅收征管、稅收行政復議和稅收行政糾紛三種，發(fā)票管理涉及發(fā)票的認定、使用、銷毀等。