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根據國家相關的稅法和勞動法規(guī)定，工資發(fā)放中扣除員工工資的科目一般有社會保險金、個人所得稅、住房公積金等。具體的科目設置受各種規(guī)定的約束，一般企業(yè)會根據當地的稅務部門提供的發(fā)放標準，來確定扣除工資的科目。一般情況下，扣除工資的科目包括：社會保險金，又稱社保，是指一定比例從工資中抽取的費用，這些費用一般用于覆蓋社會保障費用；住房公積金，是指公司和勞動者雙方各自繳納一定比例的金額，用于住房購置等；個人所得稅，是指根據個人收入差異計算出的抽取費用，專指向國家繳納的個人所得稅。 在確定扣除員工工資的科目時，企業(yè)應根據當地的稅務部門的標準規(guī)定來確定，這是有必要的，也是科學的。另外，企業(yè)還需要根據當地有關法律法規(guī)，通過稅務部門的指導，確定員工工資扣除的科目，避免因稅務行為而產生違法影響。拓展知識：現行稅法規(guī)定，企業(yè)應當依照有關規(guī)定繳納個人所得稅，個人所得稅是一項居民按相應標準支付的財政收入，一般是按勞動收入所得的營業(yè)收入，股息、利息、財產轉讓所得等收入均有可能產生個人所得稅。