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2019年10月5日，某企業(yè)申報2019年4-9月的留抵退稅，同時也申報了免抵退稅。該企業(yè)2019年9月的期末留抵稅額為100萬元。10月20日，稅務機關核準其免抵退稅應退稅額為50萬元。11月5日，納稅人完成了納稅申報，且申報了免抵退稅，當期期末留抵稅額為120萬元。11月10日核準留抵退稅時，應如何計算留抵退稅應退稅額？ 解析 11月10日核準留抵退稅時，該企業(yè)已于11月5日完成了納稅申報，最近一期申報表的期末留抵稅額中，已扣減了50萬元免抵退稅應退稅額。根據(jù)20號公告第九條第一項規(guī)定，因納稅申報、稽查查補和評估調(diào)整等原因，造成期末留抵稅額發(fā)生變化的，按最近一期《增值稅納稅申報表（一般納稅人適用）》期末留抵稅額確定允許退還的增量留抵稅額，因此直接以期末留抵稅額120萬元為依據(jù)，計算留抵退稅應退稅額。