【問題】
我是河南省某市企業(yè)的一位財務人員，我所在的公司是某企業(yè)集團下屬的子公司，為獨立法人，在當?shù)乩U納企業(yè)所得稅。近期，集團總部在內(nèi)部審計中發(fā)現(xiàn)我公司在2008年企業(yè)所得稅年度申報時對發(fā)生的研究開發(fā)費用沒有進行加計扣除處理，導致多繳了稅金。請問我們能否在2009年企業(yè)所得稅匯算清繳時補充加計扣除？或者能不能按征管法規(guī)定對未加計扣除的數(shù)額按多繳稅款處理，調(diào)整當年申報，向稅務機關(guān)申請退稅或抵稅？
【解答】
研發(fā)費用加計扣除作為稅收優(yōu)惠，只能在發(fā)生當年享受，年度匯算清繳期過后，不能在以后年度補充扣除加計部分。另外，未及時加計扣除不屬于計算錯誤情況，也不能申請退稅或抵稅。
《國家稅務總局關(guān)于企業(yè)所得稅稅收優(yōu)惠管理問題的補充通知》（國稅函[2009]255號）規(guī)定，列入企業(yè)所得稅優(yōu)惠管理的各類企業(yè)所得稅優(yōu)惠包括免稅收入、定期減免稅、優(yōu)惠稅率、加計扣除、抵扣應納稅所得額、加速折舊、減計收入、稅額抵免和其他專項優(yōu)惠政策。除國務院明確的企業(yè)所得稅過渡類優(yōu)惠政策、執(zhí)行新稅法后繼續(xù)保留執(zhí)行的原企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策、新企業(yè)所得稅法第二十九條規(guī)定的民族自治地方企業(yè)減免稅優(yōu)惠政策，以及國務院另行規(guī)定實行審批管理的企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策外，其他各類企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策，均實行備案管理。按照此項規(guī)定，加計扣除就屬于列入企業(yè)所得稅優(yōu)惠管理的項目，實行備案管理。
國稅函[2009]255號同時規(guī)定，備案管理的具體方式分為事先備案和事后報送相關(guān)資料兩種。具體劃分除國家稅務總局確定的外，由各省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列 市國家稅務局和地方稅務局在協(xié)商一致的基礎上確定。列入事先備案的稅收優(yōu)惠，納稅人應向稅務機關(guān)報送相關(guān)資料，提請備案，經(jīng)稅務機關(guān)登記備案后執(zhí)行。
對需要事先向稅務機關(guān)備案而未按規(guī)定備案的，納稅人不得享受稅收優(yōu)惠；經(jīng)稅務機關(guān)審核不符合稅收優(yōu)惠條件的，稅務機關(guān)應書面通知納稅人不得享受稅收優(yōu)惠。列入事后報送相關(guān)資料的稅收優(yōu)惠，納稅人應按照新企業(yè)所得稅法及其實施條例和其他有關(guān)稅收規(guī)定，在年度納稅申報時附報相關(guān)資料，主管稅務機關(guān)審核后如發(fā)現(xiàn)其不符合享受稅收優(yōu)惠政策的條件，應取消其自行享受的稅收優(yōu)惠，并相應追繳稅款。
各省針對事先備案和事后報送相關(guān)資料的具體劃分都有詳細的規(guī)定。如河南省就將加計扣除按事先備案的稅收優(yōu)惠處理，要求納稅年度終了后至報送年度納稅申報表前向主管稅務機關(guān)辦理備案手續(xù)。由于該企業(yè)沒按要求事先向稅務機關(guān)辦理備案，所以也就不得享受稅收優(yōu)惠，更不能在2009年所得稅匯算清繳時補扣。
關(guān)于退稅或抵頂稅款，根據(jù)《稅收征管法》第五十一條規(guī)定，納稅人超過應納稅額繳納的稅款，稅務機關(guān)發(fā)現(xiàn)后應當立即退還；納稅人自結(jié)算繳納稅款之日起3年內(nèi)發(fā)現(xiàn)的，可以向稅務機關(guān)要求退還多繳的稅款并加算銀行同期存款利息，稅務機關(guān)及時查實后應當立即退還；涉及從國庫中退庫的，依照法律、行政法規(guī)有關(guān)國庫管理的規(guī)定退還。
由于該企業(yè)沒有事先備案，不能享受加計扣除稅收優(yōu)惠，也就不能調(diào)整申報數(shù)據(jù)，沒有形成多繳稅款，也就沒有稅款可退或抵。