填開紅字發(fā)票就意味著要沖減銷售收入和銷項稅額，使當期的應(yīng)納增值稅稅額減少，因此，填開紅字專用發(fā)票一直是增值稅專用發(fā)票管理的主要內(nèi)容，除基本法規(guī)規(guī)定外，近年來還出臺了一些補充文件，現(xiàn)一一介紹如下：
一、基本法規(guī)規(guī)定
2006年10月17日《國家稅務(wù)總局關(guān)于修訂〈增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定〉的通知》（國稅發(fā)[2006]156號）對原《增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定》進行了重新修訂，規(guī)定：購買方一般納稅人取得專用發(fā)票后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤等情形但不符合作廢條件的，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓的，購買方應(yīng)向其主管稅務(wù)機關(guān)填報《開具紅字增值稅專用發(fā)票申請單》（以下簡稱《申請單》）申請開具紅字增值稅專用發(fā)票。購買方主管稅務(wù)機關(guān)對《申請單》及相關(guān)的增值稅專用發(fā)票審核無誤后，向銷售方簽發(fā)《開具紅字增值稅專用發(fā)票通知單》（以下簡稱《通知單》）。銷售方憑加蓋有購買方主管稅務(wù)機關(guān)印章的《通知單》開具紅字專用發(fā)票。
二、補充規(guī)定
1、2006年12月29日《國家稅務(wù)總局關(guān)于納稅人折扣折讓行為開具紅字增值稅專用發(fā)票問題的通知》（國稅函[2006]1279號）規(guī)定：因市場價格下降等原因，納稅人銷售貨物并向購買方開具增值稅專用發(fā)票后，由于購貨方在一定時期內(nèi)累計購買貨物達到一定數(shù)量，或者由于市場價格下降等原因，銷貨方給予購貨方相應(yīng)的價格優(yōu)惠或補償?shù)日劭�、折讓行為，銷貨方可按現(xiàn)行《增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定》的有關(guān)規(guī)定開具紅字增值稅專用發(fā)票。
2、2007年2月16日《國家稅務(wù)總局關(guān)于修訂增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定的補充通知》（國稅發(fā)[2007]18號，以下簡稱財企[2009]242號）對發(fā)生銷貨退回、銷售折讓以及開票有誤等情況需要開具紅字專用發(fā)問題作出了如下補充規(guī)定：
�。�1）因?qū)Ｓ冒l(fā)票抵扣聯(lián)、發(fā)票聯(lián)均無法認證或購買方所購貨物不屬于增值稅扣稅項目范圍，取得的專用發(fā)票未經(jīng)認證的的，由購買方填報《申請單》，并在《申請單》上填寫具體原因以及相對應(yīng)藍字專用發(fā)票的信息，經(jīng)其主管稅務(wù)機關(guān)審核后出具《通知單》，銷售方憑《通知單》開具紅字增值稅專用發(fā)票。
�。�2）因開票有誤購買方拒收增值稅專用發(fā)票的，銷售方須在自開票之日起90日內(nèi)向主管稅務(wù)機關(guān)填報《申請單》，并在《申請單》上填寫具體原因以及相對應(yīng)藍字專用發(fā)票的信息，同時提供由購買方出具的寫明拒收理由、錯誤具體項目以及正確內(nèi)容的書面材料，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核確認后簽發(fā)《通知單》。銷售方憑其主管稅務(wù)機關(guān)簽發(fā)的《通知單》開具紅字專用發(fā)票。
�。�3）因開票有誤等原因尚未將專用發(fā)票交付購買方的，銷售方須在開具有誤專用發(fā)票的次月內(nèi)向主管稅務(wù)機關(guān)填報《申請單》，并在《申請單》上填寫具體原因以及相對應(yīng)藍字專用發(fā)票的信息，同時提供寫明具體理由、錯誤具體項目以及正確內(nèi)容的書面材料，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核確認后出具《通知單》。銷售方憑《通知單》開具紅字專用發(fā)票。
（4）發(fā)生銷貨退回或銷售折讓的，除按照規(guī)定開具紅字增值稅專用發(fā)票外，銷售方還應(yīng)在開具紅字專用發(fā)票后將該筆業(yè)務(wù)的相應(yīng)記賬憑證復(fù)印件報送主管稅務(wù)機關(guān)備案。
3、2008年08月25日《國家稅務(wù)總局關(guān)于紅字增值稅專用發(fā)票通知單管理系統(tǒng)推行工作的通知》（國稅函[2008]761號）規(guī)定：從2008年10月1日起，全國國稅系統(tǒng)必須使用紅字發(fā)票通知單管理系統(tǒng)開具《通知單》，購買方在2008年10月1日以后取得的按原方式開具的《通知單》，必須在2008年11月30日之前開具紅字增值稅專用發(fā)票，2008年12月1日之后不得再作為開具紅字增值稅專用發(fā)票的依據(jù)。
4、2009年5月25日《國家稅務(wù)總局關(guān)于卷煙消費稅計稅依據(jù)有關(guān)問題的通知》（國稅函[2009]271號）規(guī)定，卷煙工業(yè)企業(yè)在卷煙消費稅實行最低計稅價格后開具的專用發(fā)票不符合作廢條件，卷煙調(diào)撥價格調(diào)高的，可按差額另行開具專用發(fā)票；卷煙調(diào)撥價格調(diào)低，已將專用發(fā)票交付卷煙批發(fā)企業(yè)的，由卷煙批發(fā)企業(yè)填報《申請單》，取得主管稅務(wù)機關(guān)出具的《通知單》后交卷煙工業(yè)企業(yè)開具紅字增值稅專用發(fā)票；卷煙調(diào)撥價格調(diào)低，尚未將專用發(fā)票交付卷煙批發(fā)企業(yè)的，由卷煙工業(yè)企業(yè)填報《申請單》，取得主管稅務(wù)機關(guān)出具的《通知單》后開具紅字增值稅專用發(fā)票。
總之，納稅人在開具紅字增值稅專用發(fā)票時必須得憑購銷雙方的《通知單》開具，否則不得沖減本期的銷售收入和銷項稅額。