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是的，自收自支事業(yè)單位也需要使用預(yù)算一體化系統(tǒng)進(jìn)行做賬。預(yù)算一體化系統(tǒng)是為了加強(qiáng)事業(yè)單位的預(yù)算管理、資金管理、會(huì)計(jì)核算和監(jiān)督等工作的信息化、規(guī)范化而建立的一套集成化的管理系統(tǒng)。通過(guò)該系統(tǒng)，事業(yè)單位可以實(shí)現(xiàn)各項(xiàng)預(yù)算、收支、核算等業(yè)務(wù)的全面管理，提高管理效率和準(zhǔn)確性，同時(shí)也有助于加強(qiáng)監(jiān)督和規(guī)范管理流程。因此，自收自支事業(yè)單位也需要按照相關(guān)規(guī)定和要求，使用預(yù)算一體化系統(tǒng)進(jìn)行做賬，并確保數(shù)據(jù)的真實(shí)、準(zhǔn)確和完整。