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綜合所得年度匯算清繳的辦理方式包括網(wǎng)上匯算清繳、自行匯算清繳和專管稅務機關代收代繳匯算清繳三種方式。其中，網(wǎng)上匯算清繳是指，納稅人通過金稅盤等納稅專用工具，在網(wǎng)上登錄申報系統(tǒng)，自行完成匯算清繳。自行匯算清繳指的是，納稅人按照稅務機關的要求，填寫報表，通過郵寄或者交到稅務機關辦稅大廳辦理匯算清繳；專管稅務機關代收代繳匯算清繳，指的是納稅人將匯算清繳款項交到有收繳資質的銀行網(wǎng)點或政府采購領域的指定收繳點，由專管稅務機關代繳至地稅局。 拓展知識： 綜合所得年度匯算清繳的如果出現(xiàn)逾期未匯算清繳的，一般情況下都會處以罰款，罰款基數(shù)即為匯款清繳金額，罰款標準是以墊款金額為基數(shù)，每天按0.05%計算，墊款金額超過100萬元的，按0.07%計收。 應用案例： 2019年6月，一家名為深圳市XX公司的公司經營不善，繳納個人所得稅期限逾期未匯清，未經申請，不符合條件前置審批。因此，這家公司將通過網(wǎng)上匯算清繳的方式，自行完成對應的匯算清繳申報工作，并在納稅期限內完成稅款支付。