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企業(yè)所得稅退稅處理方式主要有以下幾種： 1、按時(shí)繳納稅款的，根據(jù)《企業(yè)所得稅法》規(guī)定，可以在一定期限內(nèi)由稅務(wù)機(jī)關(guān)出具的稅款退還憑證，申請(qǐng)退還稅款。 2、繳款義務(wù)人未按規(guī)定時(shí)間繳納稅款的，如果后續(xù)履行繳納義務(wù)，并在法定期限內(nèi)補(bǔ)繳全部欠稅，可以申請(qǐng)稅務(wù)機(jī)關(guān)出具稅款退還憑證，以便于退還多繳稅款。 3、按照有關(guān)規(guī)定，稅務(wù)機(jī)關(guān)出具的稅款退還憑證，有效期為3年，過期后視為撤銷。 4、稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)企業(yè)的報(bào)稅不規(guī)范行為，或者違反稅收法規(guī)的情況，有權(quán)取消企業(yè)的稅款退還申請(qǐng)，并根據(jù)有關(guān)規(guī)定處理。