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是的，如果員工在北京子公司和香港母公司各發(fā)一部分工資，他的個稅一般只代扣代繳北京部分。由于中國實(shí)行了國土原則，即所得稅應(yīng)當(dāng)在依法設(shè)立的辦稅機(jī)關(guān)所在地（即mainland China）繳納，因此，員工應(yīng)該在主要工作地點(diǎn)（北京）繳納個稅。此外，如果員工具備稅收雙重征管條件，則需要向稅務(wù)機(jī)關(guān)申報，由稅務(wù)機(jī)關(guān)做出決定。 拓展知識：跨境職工的稅務(wù)處理規(guī)定，除國家稅務(wù)總局公布的特殊稅收協(xié)定外，稅務(wù)部門還制定了《跨境職工完稅服務(wù)指南》，明確規(guī)定跨境服務(wù)人員應(yīng)當(dāng)繳納主要工作地所得稅，按照稅收慣例繳納雙重征管稅款。