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小規(guī)模納稅人銷售水杯開增值稅發(fā)票的稅率為3%。按照稅收法規(guī)定，小規(guī)模納稅人屬于低稅率類，根據《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》（以下簡稱《企業(yè)所得稅法》）第四十五條，“小規(guī)模納稅人因出售水杯取得的營業(yè)收入，應納稅額不超過50萬元的，稅率為3%”。此外，國家還規(guī)定，小規(guī)模納稅人投入生產經營活動抵扣的進項稅額也從17%改為16%，減輕了小規(guī)模納稅人的負擔。 拓展知識：企業(yè)所得稅的稅率有分類，其中一般納稅人稅率為25%，小規(guī)模納稅人稅率為3%。小規(guī)模納稅人指根據稅法有關要求，符合小規(guī)模納稅所得額條件，且納稅人期末時無其他增值稅專用發(fā)票應開具專用發(fā)票或普通發(fā)票的企業(yè)、機關、事業(yè)單位和個體工商戶。