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不抵扣勾選的發(fā)票抵扣聯(lián)需要根據(jù)實際情況辦理，如發(fā)票有效截至日期未到期，可向稅務(wù)部門申請補開；如發(fā)票有效截至日期已過期，可依據(jù)稅務(wù)法有關(guān)規(guī)定，在稅收征收事項上申請退稅；如發(fā)票是逾期未開具的，可通過申請進行補開；如發(fā)票是重復(fù)開具的，可首先發(fā)送發(fā)票至稅務(wù)部門納稅服務(wù)廳進行作廢。此外，增值稅系統(tǒng)在跨地區(qū)發(fā)票核銷、以及納稅人登記地發(fā)票自行開具抵扣情況下，也可以申請發(fā)票抵扣聯(lián)，申請方法是另外一個比較復(fù)雜的過程，應(yīng)當(dāng)著重按要求準(zhǔn)確完整地填寫所需資料。拓展知識：發(fā)票抵扣聯(lián)的做法，是稅務(wù)機關(guān)在有關(guān)稅收征收事項中，識別發(fā)票抵扣信息，在發(fā)票上加蓋“發(fā)票抵扣聯(lián)”，以此達到發(fā)票抵扣效果。