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根據(jù)《中華人民共和國個人所得稅法》規(guī)定，收入減去捐贈后的應(yīng)納個人所得稅額為3000元。 具體計算方法：該設(shè)計師的應(yīng)納稅額=收入額（40000）-（收入額-5000）*稅率-速算扣除數(shù)=40000-（40000-5000）*20%-5000=3000元，即該設(shè)計師應(yīng)納個人所得稅3000元。 拓展知識： 個人所得稅的稅率經(jīng)歷了三次調(diào)整，從最初的5%調(diào)整到10%，再到20%，再到現(xiàn)在的25%。稅率除了不同的范圍不一樣，收入額超出某個范圍之后，稅率會發(fā)生變化。因此，要想準確計算應(yīng)納稅額，需要了解最新的個人所得稅法規(guī)定。