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計算農(nóng)產(chǎn)品免稅發(fā)票認(rèn)證抵扣稅額的方法為：首先，確定認(rèn)證的農(nóng)產(chǎn)品的稅率。根據(jù)《中華人民共和國營業(yè)稅暫行條例》第二十六條規(guī)定，認(rèn)定的營業(yè)稅稅率為“零稅率”；然后，計算出每一項農(nóng)產(chǎn)品認(rèn)證抵扣稅額，把每一項農(nóng)產(chǎn)品認(rèn)證抵扣稅額加總，就是最終的農(nóng)產(chǎn)品認(rèn)證抵扣稅額。 如果要申請農(nóng)產(chǎn)品免稅發(fā)票，還應(yīng)按照國家關(guān)于農(nóng)業(yè)稅收優(yōu)惠政策的相關(guān)規(guī)定，向稅收機關(guān)準(zhǔn)確提供農(nóng)產(chǎn)品的認(rèn)證等相關(guān)信息，以便做到全面信息的確認(rèn)，以達(dá)到真正的稅收優(yōu)惠效果。最后，建議有辦理農(nóng)產(chǎn)品免稅發(fā)票需求的申請人，可以向稅收機關(guān)詢問相關(guān)政策，并及時上報相關(guān)稅費等情況，以使準(zhǔn)確計算稅收優(yōu)惠，最大限度減少負(fù)擔(dān)。