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是的，持有有效的專用發(fā)票可以抵扣附加稅。抵扣附加稅的專用發(fā)票通常由購貨方在購買時向銷貨方提供，銷貨方收到發(fā)票后按照稅務(wù)管理的要求據(jù)實開具，并應(yīng)向稅務(wù)機關(guān)申報、繳納附加稅，按照有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。除本地企業(yè)抵扣本地附加稅的發(fā)票外，跨地區(qū)的購銷發(fā)票，購貨方應(yīng)當(dāng)填寫《增值稅稅負(fù)分擔(dān)表》，由購貨方承擔(dān)本地附加稅，抵扣本地附加稅。 除此之外，有效的專用發(fā)票還可以抵扣神農(nóng)氏附加稅和教育費附加等其他附加稅。專用發(fā)票抵扣的附加稅，不用在普通發(fā)票中重復(fù)繳納，但是不能將發(fā)票用于其他目的，以免被稅務(wù)機關(guān)追稅。另外，專用發(fā)票中的稅款應(yīng)當(dāng)按有關(guān)規(guī)定準(zhǔn)時繳納，以免受到罰款、補稅等處罰。