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是的，公司發(fā)票留底未認證的發(fā)票到年報的時候，如果還有上百萬未認證，稅務局是可以查到這些未認證發(fā)票的。 稅務局會通過對公司廢棄發(fā)票的檢查來發(fā)現(xiàn)未認證的發(fā)票。 如果發(fā)現(xiàn)未認證的發(fā)票，稅務局有權查封公司的賬務處理文件，申請審查，搜查及查封公司的財產。 如果發(fā)現(xiàn)未認證的發(fā)票，稅務局可以對公司作出行政處罰，包括罰款和滯納金等。此外，稅務局還有可能將公司列為企業(yè)稅收違法黑名單，并將黑名單公布給社會，企業(yè)以后就無法申領發(fā)票，可能會受到更多的行政處罰。 拓展：稅務局有權查封公司的賬務處理文件，審查公司的稅收事項，打擊公司稅務違法犯罪活動；稅務機關應當加強對納稅人的教育和管理，引導納稅人正確申報納稅，完善稅務行為監(jiān)督，積極發(fā)現(xiàn)和處理稅務違法行為。