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分公司應該匯總到總公司后申報企業(yè)所得稅，但涉及納稅所屬地問題，以及事關(guān)各地主管稅務機關(guān)的任務目標，情況有點復雜。一般來說是，就地預繳，集中清算。 具體說明如下： 首先，必須明確，該獨立核算的分公司企業(yè)是否確實具有法人資格，這點可以從該公司的營業(yè)執(zhí)照上獲取信息。從理論上說，分公司是指在業(yè)務、資金、人事等方面受總公司管轄而不具有法人資格的分支機構(gòu)，在法律上、經(jīng)濟上沒有獨立性，沒有自己的名稱、章程，也沒有自己的財產(chǎn)，并以總公司的資產(chǎn)對分公司的債務承擔法律責任。 情況一、如果確實是分公司，一般說來，應當通過總公司匯總申報并繳納企業(yè)所得稅。但在實際操作過程中，由于它涉及納稅所屬地問題，以及事關(guān)各地主管稅務機關(guān)的任務目標，情況有點復雜，尤其是分公司的規(guī)模比較大的時候。 在這樣的情況下，理論上的東西都是空的，只有與當?shù)囟悇諜C關(guān)搞好關(guān)系，協(xié)調(diào)好總公司與分公司的稅收分割問題。關(guān)系好了，如果不是當年任務完不成，稅務機關(guān)不會太為難企業(yè)。他們一般會要求分公司在當?shù)仡A繳一部分所得稅，然后在總公司匯算清繳時，“多退少補”。 所以，平時報送稅務局的報表應做低利潤，減少預繳稅額，等匯算清繳時，再按實際來申報，盡量規(guī)避“多退”的問題（稅務局收進去的錢一般不會退回，如果非得退，他們會派人來查帳，那你就等著老板訓吧）。情況二、如果是子公司（現(xiàn)在很多人分公司和子公司概念混淆），具有法人資格，一般說來，是就地申報并繳納所得稅。