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耕地占用稅是在全國范圍內(nèi)，就改變耕地用途的行為在土地取得環(huán)節(jié)一次性征收的稅種，目的是保護耕地。

而城鎮(zhèn)土地使用稅是在城市、縣城、建制鎮(zhèn)和工礦區(qū)范圍內(nèi)，在土地的持有和使用環(huán)節(jié)征收的一種稅，目的是引導(dǎo)企業(yè)集約、節(jié)約土地，促進土地資源的合理配置。

城鎮(zhèn)土地使用稅按年計算，分期繳納。城鎮(zhèn)土地使用稅和耕地占用稅是在不同環(huán)節(jié)征收的稅種，因此，占用耕地的納稅人在繳納耕地占用稅以后，在土地持有和使用過程中仍要繳納城鎮(zhèn)土地使用稅。但是在占用耕地的當(dāng)年，考慮到納稅人已經(jīng)支付了較高的補償費、繳納了耕地占用稅，因此，《城鎮(zhèn)土地使用稅暫行條例》將其繳納城鎮(zhèn)土地使用稅的納稅義務(wù)發(fā)生時間設(shè)置為批準征用耕地的1年以后，從而保證耕地占用稅和城鎮(zhèn)土地使用稅的合理銜接。