《企業(yè)研究開發(fā)費用稅前扣除管理辦法》規(guī)定，企業(yè)根據(jù)財務(wù)會計核算和研發(fā)項目的實際情況，對發(fā)生的研發(fā)費用進行收益化或資本化處理的，可按下述規(guī)定計算加計扣除：
�。�1）加計抵扣。研發(fā)費用計入當期損益未形成無形資產(chǎn)的，允許再按其當年研發(fā)費用實際發(fā)生額的50%，直接抵扣當年的應(yīng)納稅所得額。這里需要注意的是，《企業(yè)研究開發(fā)費用稅前扣除管理辦法》沒有對虧損企業(yè)是否可以享受該類抵扣等問題給予答復，但筆者認為，虧損企業(yè)符合條件的研發(fā)費用也可享受加計抵扣待遇。因為，無論是從應(yīng)納稅所得額的計算過程，還是結(jié)合《關(guān)于印發(fā)〈中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報表〉的通知》（國稅發(fā)[2008]101號）規(guī)定的年度申報表格式進行判斷，加計扣除的實質(zhì)都是在計算出納稅調(diào)整后所得或應(yīng)納稅所得額之前的一個扣除項目，如果虧損企業(yè)不允許扣除加計的研發(fā)費用，等于沒有計算出納稅調(diào)整后所得或應(yīng)納稅所得額。對于虧損企業(yè)扣除加計的研發(fā)費用后進一步形成的虧損，應(yīng)按照稅法對年度虧損的要求后轉(zhuǎn)5年進行補虧。
（2）加計攤銷。研發(fā)費用形成無形資產(chǎn)的，按照該無形資產(chǎn)成本的150%在稅前攤銷。除法律另有規(guī)定外，攤銷年限不得低于10年。但此規(guī)定并不等同于無形資產(chǎn)成本本身按照150%攤銷，因為進入無形資產(chǎn)成本的支出不一定都是研發(fā)費用，比如研發(fā)形成的無形資產(chǎn)成本中還可能包括一部分允許資本化的借款費用，這部分借款費用一般不能享受加計攤銷的優(yōu)惠。對于享受加計攤銷優(yōu)惠的無形資產(chǎn)而言，假設(shè)其賬面余額（原價）為500萬元，全部是研發(fā)費用，會計攤銷期為10年，不考慮預計凈殘值。攤銷方法為直線法，年末對應(yīng)的“累計攤銷”賬面余額為200萬元（截止當年年末已經(jīng)攤銷4年），則按照會計準則確定的無形資產(chǎn)賬面價值為300萬元。在企業(yè)收回資產(chǎn)賬面價值的過程中，計算應(yīng)納稅所得額時按照稅法規(guī)定可以自應(yīng)稅經(jīng)濟利益中抵扣的金額為300×150%=450（萬元），即按照所得稅會計準則確定的計稅基礎(chǔ)為450萬元。無形資產(chǎn)賬面價值300萬元和計稅基礎(chǔ)450萬元之間的差額150萬元屬于可抵扣暫時性差異，如果假定該企業(yè)屬于國家需要重點扶持的高新技術(shù)企業(yè)，適用15%的所得稅優(yōu)惠稅率，并且企業(yè)預計很可能取得足夠的用來抵扣可抵扣暫時性差異的應(yīng)納稅所得額，則該企業(yè)年末應(yīng)確認的遞研所得稅資產(chǎn)為22.5萬元。
需要說明的是，稅法沒有對研發(fā)費用的費用化處理或資本化處理的適用條件進行規(guī)范，此時，只能依據(jù)會計準則的相關(guān)規(guī)定進行判斷。對于企業(yè)自行進行的研發(fā)項目，無形資產(chǎn)準則要求區(qū)分研究階段與開發(fā)階段分別進行核算。研究活動是否能在未來形成成果，即通過開發(fā)后是否會形成無形資產(chǎn)均有很大的不確定性，企業(yè)也無法證明其研究活動一定能夠形成帶來未來經(jīng)濟利益的無形資產(chǎn)，因此，研究階段的有關(guān)支出在發(fā)生時應(yīng)費用化計入當期損益。而開發(fā)階段相對于研究階段更進一步，且很大程度上形成一項新產(chǎn)品或新技術(shù)的基本條件已經(jīng)具備，此時如果企業(yè)能證明滿足無形資產(chǎn)的定義及相關(guān)確認條件，則所發(fā)生的開發(fā)支出可按無形資產(chǎn)會計準則予以資本化，確認為無形資產(chǎn)的成本。