（一）進(jìn)項(xiàng)稅額
1.用于抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的增值稅專用發(fā)票是否真實(shí)合法：是否有開票單位與收款單位不一致或票面所記載貨物與實(shí)際入庫(kù)貨物不一致的發(fā)票用于抵扣。
2.用于抵扣進(jìn)項(xiàng)的運(yùn)費(fèi)發(fā)票是否真實(shí)合法；是否有與購(gòu)進(jìn)和銷售貨物無關(guān)的運(yùn)費(fèi)申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額；是否有以購(gòu)進(jìn)固定資產(chǎn)發(fā)生的運(yùn)費(fèi)或銷售免納增值稅的固定資產(chǎn)發(fā)生的運(yùn)費(fèi)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額；是否有以國(guó)際貨物運(yùn)輸代為辦理業(yè)發(fā)票和國(guó)際貨物運(yùn)輸發(fā)票抵扣進(jìn)項(xiàng)；是否存在以開票方與承運(yùn)方不一致的運(yùn)輸發(fā)票抵扣進(jìn)項(xiàng)；是否存在以項(xiàng)目填寫不齊全的運(yùn)輸發(fā)票抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額等情況。
3.是否存在未按規(guī)定開具農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)統(tǒng)一發(fā)票申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的情況，具體包括：向經(jīng)銷農(nóng)產(chǎn)品的單位和個(gè)人收購(gòu)農(nóng)產(chǎn)品開具農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)發(fā)票；擴(kuò)大農(nóng)產(chǎn)品范圍，把非免稅農(nóng)產(chǎn)品（如方木、枕木、道木、鋸材等）開具成免稅農(nóng)產(chǎn)品（如原木）；虛開農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)統(tǒng)一發(fā)票（虛開數(shù)量、單價(jià)、抵扣稅款）。
4.用于抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的廢舊物資發(fā)票是否真實(shí)合法。
5.用于抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的廢舊物資發(fā)票是否真實(shí)合法。
6.是否存在購(gòu)進(jìn)固定資產(chǎn)申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的情況。
7.是否存在購(gòu)進(jìn)材料、電、汽等貨物用于在建工程、集體福利等非應(yīng)稅項(xiàng)目等未按規(guī)定轉(zhuǎn)出進(jìn)項(xiàng)稅額的情況。
8.發(fā)生退貨或取得折讓是否按規(guī)定作進(jìn)項(xiàng)稅額轉(zhuǎn)出。
9.用于非應(yīng)稅項(xiàng)目和免稅項(xiàng)目、非正常損失的貨物是否按規(guī)定作進(jìn)項(xiàng)稅額轉(zhuǎn)出。
10.是否存在凈返利掛入其他應(yīng)付款、其他應(yīng)收款等往來賬或沖減營(yíng)業(yè)費(fèi)用，而不作進(jìn)項(xiàng)稅額轉(zhuǎn)出的情況。
（二）銷項(xiàng)稅額
1.銷售收入是否完整及時(shí)入賬：是否存在以貨易貨交易未記收入的情況：是否存在以貨抵債收入的情況：是否存在銷售產(chǎn)品不開發(fā)票，取得的收入不按規(guī)定入賬的情況；是否存在銷售收入長(zhǎng)期掛賬不轉(zhuǎn)收入的情況；是否存在將收取的銷售款項(xiàng)，先支付費(fèi)用（如購(gòu)貨方的回扣、推銷獎(jiǎng)、營(yíng)業(yè)費(fèi)用、委托代銷商品的手續(xù)費(fèi)等），再將余款入賬作收入的情況。
2.是否存在視同銷售行為，未按規(guī)定計(jì)提銷項(xiàng)稅額的情況：將自產(chǎn)或委托加工的貨物用于非應(yīng)稅項(xiàng)目、集體福利或個(gè)人消費(fèi)，如用于內(nèi)設(shè)的食堂、賓館、醫(yī)院、托兒所、學(xué)校、俱樂部、家屬社區(qū)等部門，不計(jì)或少計(jì)應(yīng)稅收入；將自產(chǎn)、委托加工或購(gòu)買的貨物用于投資、分配、無償捐助等、不計(jì)或少計(jì)應(yīng)稅收入。
3.是否存在開具不符合規(guī)定的紅字發(fā)票沖減應(yīng)稅收入的情況；發(fā)生銷貨退回，銷售折扣或折讓，開具的紅字發(fā)票和賬務(wù)處理是否符合稅法規(guī)定。
4.是否存在購(gòu)進(jìn)的材料、水、電、汽等貨物用于對(duì)外銷售、投資、分配及無償贈(zèng)送，不計(jì)或少計(jì)應(yīng)稅收入的情況：收取外單位或個(gè)人水、電、汽等費(fèi)用，不計(jì)、少計(jì)收入或沖減費(fèi)用；將外購(gòu)的材料改變用途，對(duì)外銷售、投資、分配及無償贈(zèng)送等未按視同銷售的規(guī)定計(jì)稅。
5.向購(gòu)貨方收取的各種價(jià)外費(fèi)用（例如手續(xù)費(fèi)、補(bǔ)貼、集資費(fèi)、返還利潤(rùn)、獎(jiǎng)勵(lì)費(fèi)、違約金、運(yùn)輸裝卸費(fèi)等等）是否按規(guī)定納稅。
6.設(shè)有兩個(gè)以上的機(jī)構(gòu)并實(shí)行統(tǒng)一核算的納稅人，將貨物從一個(gè)機(jī)構(gòu)移送到其他機(jī)構(gòu)（不在同一縣市）用于銷售，是否作銷售處理。
7.對(duì)逾期未收回的包裝物押金是否按規(guī)定計(jì)提銷項(xiàng)稅額。
8.是否有應(yīng)繳納增值稅項(xiàng)目的業(yè)務(wù)按工營(yíng)業(yè)稅繳納。
9.增值稅混合銷售行為是否依法納稅：對(duì)增值稅稅法規(guī)定應(yīng)視同銷售征稅的行為是否按規(guī)定納稅；從事貨物運(yùn)輸業(yè)務(wù)的單位和個(gè)人，發(fā)生銷售貨物并負(fù)責(zé)運(yùn)輸所售貨物的混合銷售行為，是否按規(guī)定繳納增值稅。
10.兼營(yíng)的非應(yīng)稅勞務(wù)的納稅人，是否按規(guī)定分別核算貨物或應(yīng)稅勞務(wù)和非應(yīng)稅勞務(wù)的銷售額；對(duì)不分別核算或者不能準(zhǔn)確核算的，是否按增值稅的規(guī)定一并繳納增值稅。
11.按照增值稅稅法規(guī)定應(yīng)征收增值稅的代購(gòu)貨物、代為辦理進(jìn)口貨物的行為，是否繳納了增值稅。
12.免稅貨物是否依法核算：增值稅納稅人免征增值稅的貨物或應(yīng)稅勞務(wù)，是否符合稅法的有關(guān)規(guī)定；有無擅自擴(kuò)大免稅范圍的問題；軍隊(duì)、軍工系統(tǒng)的增值稅納稅人，其免稅的企業(yè)、貨物和勞務(wù)范圍是事符合稅法的規(guī)定；福利、校辦企業(yè)其免稅的企業(yè)、貨物和勞務(wù)范圍是否符合稅法的規(guī)定；兼營(yíng)免稅項(xiàng)目的增值稅一般納稅人，其免稅額、不予抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額計(jì)算是否準(zhǔn)確？