存貨的非正常損耗主要有兩種原因：（一）自然災害損失；（二）因管理不善造成貨物被盜竊、發(fā)生霉爛變質(zhì)等損失。前者在扣除保險公司等賠償后計入“營業(yè)外支出”，后者在扣除有關(guān)責任人員賠償后計入“管理費用”。但是“自然災害損失”，必須是“事前不可知、事中不可控、事后有證據(jù)”的損失。對于原因不明的損失，只能歸于“管理不善”，計入“營業(yè)外支出”。

　　有關(guān)稅收事項：

　　1、增值稅：根據(jù)增值稅條例，非正常損耗，不論是什么原因，對應轉(zhuǎn)出相應的進項稅額；

　　對于毀損的存貨是否要轉(zhuǎn)出進項稅額？對于毀損的存貨是否要轉(zhuǎn)出進項稅額？有不同的觀點：（1）、認為可不轉(zhuǎn)出，因為存貨毀損，與管理不善而造成的“被盜、霉爛變質(zhì)”不同，稅法也沒有對這方面要轉(zhuǎn)出進項稅的規(guī)定，對此項存貨損失，所以可以不作轉(zhuǎn)出進項稅的處理；（2）、應轉(zhuǎn)出。雖然沒有明確的法規(guī)要求這種情況進項稅要轉(zhuǎn)出，但從增值稅計稅原理來講，企業(yè)為生產(chǎn)或流通購進貨物所負擔的進項稅額可從當期銷項稅中抵扣，但這種抵扣是有條件的，即準予抵扣的進項稅額必須是用于應稅生產(chǎn)或流通的購進貨物所負擔的進項稅額。既然存貨已毀損而不能用于生產(chǎn)應稅貨物或進入流通，當然也就不能抵扣。兩種說法都有道理，你是傾向于后者，還是更欣賞前者？

　　2、所得稅處理 對于計入“管理費用”的因“管理不善”造成的損失，因為屬于責任單位管理上的原因，國家不可能因此而受稅款的損失，因此這部分損失不能在稅前扣除；而對于自然災害造成的損失，不是企業(yè)主觀原因造成的，根據(jù)國稅發(fā)[1997]190號文件規(guī)定，納稅人在一個納稅年度內(nèi)生產(chǎn)經(jīng)營過程中發(fā)生的固定資產(chǎn)、流動資產(chǎn)的盤虧、毀損、報廢凈損失、壞賬損失，以及遭受自然災害等人類無法抗拒因素造成的非常損失，經(jīng)稅務機關(guān)審查批準后，準予在繳納企業(yè)所得稅前扣除。應該可以在稅前扣除。也就是說，“管理費用”中存貨的非正常損失，不能在稅前扣除，須作納稅調(diào)增，而“營業(yè)外支出”中的損失，可在稅前扣除，不用作納稅調(diào)整。

　　那么該如何理解國稅發(fā)[2003]45號文這段話：當存貨發(fā)生以下一項或若干情況時，應當視為永久或?qū)嵸|(zhì)性損害：

　　1.已霉爛變質(zhì)的存貨；

　　2.已過期且無轉(zhuǎn)讓價值的存貨；

　　3.經(jīng)營中已不再需要，并且已無使用價值和轉(zhuǎn)讓價值的存貨；

　　4.其他足以證明已無使用價值和轉(zhuǎn)讓價值的存貨。

　　我認為應該是客觀原因造成上述情況的才能扣除。不過事實上稅務也不可能那么認真的，不管什么原因，只要報恐怕一般都會批的。