按照“積極穩(wěn)妥、循序漸進、確保規(guī)范”的改革思路，烏魯木齊有序推進市本級財政國庫集中支付改革，2005年選擇10個預(yù)算單位進行了改革試點；2006年依托支付軟件系統(tǒng)對55個一級預(yù)算單位實行了改革；2007年擴大到39個二級預(yù)算單位；2008年，市本級單位的預(yù)算內(nèi)、外資金全部通過支付系統(tǒng)進行管理；2009年對市本級62個預(yù)算單位實行財政國庫集中支付改革；2010年加快了改革進程，對市本級87個單位實行改革；2011年，結(jié)合預(yù)算外資金納入預(yù)算管理的要求以及預(yù)算單位性質(zhì)調(diào)整，對市本級新增的21個預(yù)算單位實行了國庫集中支付改革。截止目前，烏魯木齊市本級對統(tǒng)發(fā)工資、津貼補貼、政府采購、車輛定點加油、車輛定點保險、工會經(jīng)費、基本建設(shè)支出、科技三項費、小額維修支出等專項資金均實行了財政直接支付；從改革成本及資金量的角度考慮，對部分差額單位和自收自支單位的經(jīng)費也實行了直接支付。目前，市本級316個預(yù)算單位全部完成了國庫集中支付改革任務(wù)。