按照“積極穩(wěn)妥、循序漸進(jìn)、確保規(guī)范”的改革思路，烏魯木齊有序推進(jìn)市本級財(cái)政國庫集中支付改革，2005年選擇10個(gè)預(yù)算單位進(jìn)行了改革試點(diǎn)；2006年依托支付軟件系統(tǒng)對55個(gè)一級預(yù)算單位實(shí)行了改革；2007年擴(kuò)大到39個(gè)二級預(yù)算單位；2008年，市本級單位的預(yù)算內(nèi)、外資金全部通過支付系統(tǒng)進(jìn)行管理；2009年對市本級62個(gè)預(yù)算單位實(shí)行財(cái)政國庫集中支付改革；2010年加快了改革進(jìn)程，對市本級87個(gè)單位實(shí)行改革；2011年，結(jié)合預(yù)算外資金納入預(yù)算管理的要求以及預(yù)算單位性質(zhì)調(diào)整，對市本級新增的21個(gè)預(yù)算單位實(shí)行了國庫集中支付改革。截止目前，烏魯木齊市本級對統(tǒng)發(fā)工資、津貼補(bǔ)貼、政府采購、車輛定點(diǎn)加油、車輛定點(diǎn)保險(xiǎn)、工會(huì)經(jīng)費(fèi)、基本建設(shè)支出、科技三項(xiàng)費(fèi)、小額維修支出等專項(xiàng)資金均實(shí)行了財(cái)政直接支付；從改革成本及資金量的角度考慮，對部分差額單位和自收自支單位的經(jīng)費(fèi)也實(shí)行了直接支付。目前，市本級316個(gè)預(yù)算單位全部完成了國庫集中支付改革任務(wù)。