一是建立財政綜合監(jiān)督機制，發(fā)揮財政監(jiān)督合力。一是制定了《伊犁州本級財政監(jiān)督工作聯(lián)席會議制度》，與相關部門聯(lián)合下發(fā)了《關于建立紀檢監(jiān)察、審計、財政監(jiān)督工作計劃及檢查結果互相告知機制的通知》，在州直范圍內實現(xiàn)了信息資源共享，形成了監(jiān)督合力，提升了行政執(zhí)法效能；二是結合州本級財政監(jiān)督工作實際，出臺《伊犁州級財政綜合監(jiān)督檢查辦法》，建立了以財政各職能處室日常監(jiān)督、專項監(jiān)督為基礎、以財政監(jiān)督局重點監(jiān)督檢查和對財政各職能處室內部監(jiān)督為主體的財政綜合監(jiān)督格局。

　　二是建立完善財政內部監(jiān)督機制，提高內部監(jiān)督水平。在實施內部監(jiān)督方面，注重將內部監(jiān)督與服務財政改革、規(guī)范財政管理相結合，不斷調整財政內部監(jiān)督檢查重點及范圍，從以收支檢查為重點逐步擴大到對內部職能部門政策執(zhí)行、內控機制和履行職責等內部管理情況檢查以及預算編制、執(zhí)行、審核等程序的執(zhí)行情況檢查等多方面，及時發(fā)現(xiàn)和糾正財政管理和財政運行中存在的問題，提出整改意見，強化了財政內部權力制約，有效促進財政系統(tǒng)廉政建設工作。

　　三是建立完善監(jiān)督質量考核機制，提高財政監(jiān)督水平。檢查質量是財政監(jiān)督工作的生命線。為提高監(jiān)督質量，2005年伊犁州制定了《財政監(jiān)督檢查工作質量考核評比辦法》，2006年及2007年又對《辦法》進行了補充完善。從2008年開始，監(jiān)督質量考核全部列人州直財政工作目標考核單項獎，為做好財政監(jiān)督工作奠定了基礎。

　　四是建立完善監(jiān)督內部控制機制，強化監(jiān)督工作質量。首先是建立財政監(jiān)督檢查、復核、處理相對分開的內控機制。2009年財政監(jiān)督局內設檢查科及審理科，在內部監(jiān)督檢查、復核兩個環(huán)節(jié)上形成相互協(xié)調、相互制約、相互監(jiān)督的工作機制。其次是建立完善的監(jiān)督檢查處理機制。州本級通過定期召開財政監(jiān)督審理會的方式，部分縣市成立以財政部門主要負責人為主的財政監(jiān)督處理決策機構，定期對財政監(jiān)督專職機構查出的違紀問題進行討論、定性，并做出對違紀單位和責任人的處理意見，有力地維護了財政監(jiān)督檢查工作的嚴肅性。