近日，山東省無棣縣稅務人員在對甲公司進行納稅輔導時發(fā)現(xiàn)，甲公司對一筆股權轉讓業(yè)務的稅務處理不符合規(guī)定。甲公司與乙公司、外國某公司共同出資設立L公司，甲公司持股23%，最近因對L公司新上投資項目意見不統(tǒng)一，經(jīng)協(xié)商，甲公司將所持L公司全部股權轉讓給丙公司，該長期股權投資賬面價值168萬元，其中成本139萬元，損益調整39萬元，取得轉讓收入180萬元。甲公司按股權轉讓所得12萬元計提企業(yè)所得稅，稅務人員提醒該公司股權轉讓所得應為41萬元。
甲公司財務人員依據(jù)《企業(yè)會計準則》的規(guī)定，對該長期股權投資采用權益法核算，賬面價值包含兩部分：一部分是初始投資成本，該項初始投資成本等于投資時應享有L公司可辨認凈資產公允價值份額；另一部分是按照應享有L公司實現(xiàn)的凈損益的份額，確認投資損益并調整該投資的賬面價值。但依據(jù)《企業(yè)所得稅法實施條例》第七十一條規(guī)定，企業(yè)在轉讓或者處置投資資產時，投資資產的成本，準予扣除。投資資產按照以下方法確定成本：
（一）通過支付現(xiàn)金方式取得的投資資產，以購買價款為成本；
�。ǘ┩ㄟ^支付現(xiàn)金以外的方式取得的投資資產，以該資產的公允價值和支付的相關稅費為成本，該項投資的計稅基礎僅指購買價款，不包含該投資的損益調整部分。
《國家稅務總局關于貫徹落實企業(yè)所得稅法若干稅收問題的通知》（國稅函[2010]79號）對股權轉讓進一步明確，轉讓股權收入扣除為取得該股權所發(fā)生的成本后，為股權轉讓所得。企業(yè)在計算股權轉讓所得時，不得扣除被投資企業(yè)未分配利潤等股東留存收益中按該項股權所可能分配的金額。因此，甲公司的股權轉讓所得應為：180-139=41（萬元）。