稅務(wù)審計(jì)就其本身所具有的內(nèi)在功能來(lái)講，其職能主要有四項(xiàng)：
（一）監(jiān)督
監(jiān)督是稅務(wù)審計(jì)最基本的職能，具體地說(shuō)，就是稅務(wù)機(jī)關(guān)的管理部門(mén)在稅收法律和法規(guī)的約束范圍內(nèi)，對(duì)納稅人生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)和履行納稅義務(wù)、扣繳義務(wù)情況的真實(shí)性和公允性進(jìn)行監(jiān)督，并通過(guò)審查，揭示其錯(cuò)弊，督促納稅人遵守國(guó)家的稅收法律、法規(guī)，履行納稅義務(wù)和扣繳義務(wù)，使其經(jīng)營(yíng)行為和納稅行為做到合法、有效。
（二）評(píng)價(jià)
評(píng)價(jià)就是通過(guò)審查驗(yàn)證，依據(jù)鑿實(shí)的數(shù)據(jù)及資料，對(duì)納稅人財(cái)務(wù)核算成果是否真實(shí)合法、納稅義務(wù)和扣繳義務(wù)是否依法履行進(jìn)行評(píng)價(jià)。它是在監(jiān)督的基礎(chǔ)上，對(duì)納稅人取得的成就、存在的不足給予更深刻的揭示和說(shuō)明，從而使納稅人能不斷提高經(jīng)營(yíng)水平和納稅遵從度。
（三）鑒證
鑒證是審計(jì)活動(dòng)具有的一種共性職能，稅務(wù)審計(jì)也不例外。它是通過(guò)審核和查驗(yàn)，依審查的結(jié)果向納稅人出具查驗(yàn)證明。這種證明以書(shū)面形式公示出納稅人在財(cái)務(wù)核算和納稅行為上的真實(shí)結(jié)果，其內(nèi)容和形式都是符合法律規(guī)范的，因而具有法律效力。
（四）服務(wù)
稅務(wù)審計(jì)的服務(wù)職能主要體現(xiàn)在兩個(gè)層面：其一，納稅人財(cái)務(wù)核算和納稅申報(bào)真實(shí)、正確、可靠與否，將直接涉及國(guó)家、投資人甚至債權(quán)人的利益，通過(guò)稅務(wù)審計(jì)，揭示問(wèn)題，規(guī)范行為，為納稅人在該做什么、如何做好上提供法律參照和規(guī)范。因此，從微觀管理層面上講，稅務(wù)審計(jì)本身就是一種服務(wù)。其二，通過(guò)稅務(wù)審計(jì)的介入，使得國(guó)家在稅收管理的法律、法規(guī)、政策、制度和辦法等方面存在的問(wèn)題得以發(fā)現(xiàn)和歸集，為進(jìn)一步完善稅收管理制度，提高稅收管理水平提供導(dǎo)向和思路，進(jìn)而為國(guó)家宏觀管理決策提供服務(wù)。
稅務(wù)審計(jì)的一個(gè)作用就是，通過(guò)分析企業(yè)業(yè)務(wù)流程，查找企業(yè)經(jīng)營(yíng)管理上的漏洞，提出合理化的建議；查找企業(yè)潛在的稅務(wù)問(wèn)題，提出稅務(wù)預(yù)警，它是一種變被動(dòng)的服務(wù)為主動(dòng)的服務(wù)。
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