企業(yè)整體資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓是指一家企業(yè)不需要解散而將其經(jīng)營活動的全部（包括所有資產(chǎn)和負(fù)債）或其獨立核算的分支機構(gòu)轉(zhuǎn)讓給另一家企業(yè)，以換取代表接受企業(yè)資本的股權(quán)（包括股份或股票等），包括股份公司的法人股東以其經(jīng)營活動的全部或其獨立核算的分支機構(gòu)向股份公司配購股票。
縱觀相關(guān)政策，企業(yè)整體轉(zhuǎn)讓應(yīng)按以下原則進(jìn)行稅務(wù)處理：
1.不征收營業(yè)稅和增值稅。
根據(jù)《關(guān)于轉(zhuǎn)讓企業(yè)產(chǎn)權(quán)不征收營業(yè)稅問題的批復(fù)》 （國稅函（2002]165號）規(guī)定：轉(zhuǎn)讓企業(yè)產(chǎn)權(quán)是整體轉(zhuǎn)讓企業(yè)資產(chǎn)、債權(quán)、債務(wù)及勞動力的行為，其轉(zhuǎn)讓價格不僅僅是由資產(chǎn)價值決定的，與企業(yè)銷售不動產(chǎn)、轉(zhuǎn)讓無形資產(chǎn)的行為完全不同。因此，轉(zhuǎn)讓企業(yè)產(chǎn)權(quán)的行為不屬于營業(yè)稅征收范圍。不應(yīng)征收營業(yè)稅。
根據(jù)《關(guān)于轉(zhuǎn)讓企業(yè)全部產(chǎn)權(quán)不征收增值稅問題的批復(fù)》 （國稅函[2002] 420號）規(guī)定：轉(zhuǎn)讓企業(yè)全部產(chǎn)權(quán)是整體轉(zhuǎn)讓企業(yè)資產(chǎn)、債權(quán)、債務(wù)及勞動力的行為。因此，轉(zhuǎn)讓企業(yè)全部產(chǎn)權(quán)涉及的應(yīng)稅貨物的轉(zhuǎn)讓，不屬于增值稅的征稅范圍，不征收增值稅。
2.應(yīng)繳納印花稅和土地增值稅。
根據(jù)《印花稅暫行條例》及實施細(xì)則規(guī)定：企業(yè)整體轉(zhuǎn)讓屬企業(yè)全部財產(chǎn)的所有權(quán)轉(zhuǎn)讓，應(yīng)根據(jù)產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓所立的書據(jù)依萬分之五的稅率繳納印花稅，但企業(yè)因改制簽訂的產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)免征印花稅。
根據(jù)《土地增值稅暫行條例》及其實施細(xì)則規(guī)定：轉(zhuǎn)讓國有土地使用權(quán)、地上的建筑物及其附著物（即轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)）具有法定增值額的應(yīng)當(dāng)依法繳納土地增值稅，轉(zhuǎn)讓非國有土地使用權(quán)及地上的建筑物，其附著物則不繳納土地增值稅。
【例1】某企業(yè)始建于20世紀(jì)90年代，占用國有土地50畝，整體轉(zhuǎn)讓價格為3000萬元。經(jīng)評估機構(gòu)評估，其中轉(zhuǎn)讓土地使用權(quán)及地面房屋（現(xiàn)行市場建造價）的價格為800萬元，房屋為七成新，允許扣除的有關(guān)稅費（印花稅）1.50萬元。該企業(yè)整體轉(zhuǎn)讓后應(yīng)繳納的土地增值稅為：
評估價格=800×70％=560（萬元）
允許扣除的稅費合計1.50萬元。
扣除項目合計=560+1.50=561.50（萬元）
增值額=800-561.50=238.50（萬元）
增值率=238.50+561.50×100％=42.48％
應(yīng)納稅額=238.50×30％=71.55（萬元）
3.收入增值達(dá)比例要繳企業(yè)所得稅。
根據(jù)《關(guān)于企業(yè)股權(quán)投資業(yè)務(wù)若干所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2000]118號）規(guī)定：如果在企業(yè)整體資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓交易的接受企業(yè)支付的交換額中扣除非股權(quán)支付額高于所支付的股權(quán)的票面價值（或股本的賬面價值）20％，就應(yīng)該按照稅法的有關(guān)規(guī)定。算出清算所得繳納企業(yè)所得稅。
根據(jù)《企業(yè)所得稅法實施條例》第十一條、第六十七條規(guī)定：清算所得是指企業(yè)的全部資產(chǎn)可變現(xiàn)價值或者交易價格減除資產(chǎn)凈值、外購商譽的支出、清算費用以及相關(guān)稅費等后的余額。再根據(jù)國家稅務(wù)總局2008年6月19日發(fā)布的《企業(yè)重組與清算的所得稅處理辦法（討論稿）》的意見，即：企業(yè)的全部資產(chǎn)可變現(xiàn)價值或交易價格減除資產(chǎn)的計稅基礎(chǔ)、清算費用、相關(guān)稅費，加上債務(wù)清償損益等后的余額為清算所得。因此，這里的“資產(chǎn)凈值”應(yīng)該是納稅人的全部資產(chǎn)或者財產(chǎn)�？鄢齻鶆�(wù)清償損失、企業(yè)未分配利潤、公益金和公積金后的余額。超過實繳資本的部分；這里的“稅”應(yīng)該是按稅法規(guī)定繳納的印花稅和土地增值稅。
【例2】2007年某企業(yè)整體轉(zhuǎn)讓收入2500萬元（不含非股權(quán)支付額），經(jīng)內(nèi)部清算，企業(yè)注冊資本金為1500萬元，賬面應(yīng)付未付職工工資性款項180萬元，拖欠各類稅金100萬元，企業(yè)累計未分配利潤300萬元，企業(yè)資本公積金120萬元，外購商譽支出60萬元。
判斷是否應(yīng)該確認(rèn)資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得或損失。
（2500-1500）+1500×100％=66.67％
因該企業(yè)整體資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓交易額超過股本的賬面價值66.67％，所以，應(yīng)該確認(rèn)資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得或損失，并計算繳納企業(yè)所得稅。
計算該企業(yè)整體轉(zhuǎn)讓應(yīng)繳納的企業(yè)所得稅稅額。
2500—1500-180-100-300-120-60=240（萬元）
應(yīng)繳企業(yè)所得稅=240×33％=79.20（萬元）
4.原股東按財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得征個稅。
根據(jù)《關(guān)于股權(quán)轉(zhuǎn)讓收入征收個人所得稅問題的批復(fù)》（國稅函[2007]244號）規(guī)定：通過簽訂股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議，以轉(zhuǎn)讓公司全部資產(chǎn)方式將股權(quán)轉(zhuǎn)讓給新股東，協(xié)議約定時間以前的債權(quán)債務(wù)由原股東負(fù)責(zé)，協(xié)議約定時間以后的債權(quán)債務(wù)由新股東負(fù)責(zé)。根據(jù)《個人所得稅法》及其實施條例的規(guī)定，原股東取得股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得，應(yīng)按“財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”項目征收個人所得稅。
此外，根據(jù)《關(guān)于個人股權(quán)轉(zhuǎn)讓過程中取得違約金收人征收個人所得稅問題的批復(fù)》（國稅函[2006]866號）規(guī)定：企業(yè)整體成功轉(zhuǎn)讓后，轉(zhuǎn)讓方個人股東因受讓方未按規(guī)定期限支付價款而取得的違約金收入，屬于因財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓而產(chǎn)生的收入。轉(zhuǎn)讓方股東個人取得的該違約金應(yīng)并人財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入，按照“財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”項目計算繳納個人所得稅，但企業(yè)整體轉(zhuǎn)讓在計算股東應(yīng)繳納的個人所得稅時不涉及外部的債權(quán)債務(wù)問題。
如上述例2：假設(shè)該企業(yè)是由5名股東投資興辦的農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)，其中董事長投資500萬元，總經(jīng)理投資400萬元，其他3位股東各投資200萬元。整體轉(zhuǎn)讓過程中繳納的有關(guān)稅費合計135萬元，轉(zhuǎn)讓后另向轉(zhuǎn)入方收取延期付款違約金60萬元。
則持股人應(yīng)繳納的個人所得稅為：股東應(yīng)繳納的個人所得稅：（2500-180-100-1500-135+60）×20％=129（萬元）
其中：董事長應(yīng)繳納的個人所得稅=129+1500×500=43（萬元）
總經(jīng)理應(yīng)繳納的個人所得稅=129+1500×400=34.40（萬元）
其他3位股東各應(yīng)繳納的個人所得稅=129+1500×200=17.20（萬元）