為了貫徹《國務(wù)院辦公廳轉(zhuǎn)發(fā)科技部等部門關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個國家局所屬科研機構(gòu)管理體制改革意見的通知》、《國務(wù)院辦公廳關(guān)于批準國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個國家局所屬科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制方案的通知》的有關(guān)規(guī)定，現(xiàn)將國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個國家局所屬242個科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制后有關(guān)稅收征收管理問題明確如下：

　　一、對轉(zhuǎn)制的科研機構(gòu)，從1999年起至2003年底止，免征技術(shù)轉(zhuǎn)讓收入的營業(yè)稅；免征科研開發(fā)自用土地的城鎮(zhèn)土地使用稅；凡符合企業(yè)所得稅納稅人條件的，從1999年起至2003年底止，5年內(nèi)免征企業(yè)所得稅。（此條于2006年4月30日失效）

　　二、轉(zhuǎn)制的科研機構(gòu)交接后，企業(yè)所得稅收入歸屬及征收管理范圍，按照國家稅務(wù)總局《關(guān)于企業(yè)所得稅征收和管理范圍的通知》（國稅發(fā)〔1995〕023號）文件執(zhí)行。具體明確如下：

　?。ㄒ唬┛蒲袡C構(gòu)移交給中央各部門、各總公司、各行業(yè)協(xié)會、總會及其所屬企業(yè)、事業(yè)單位和社會團體的，以及上述企事業(yè)單位舉辦的國有企業(yè)的，其企業(yè)所得稅由國家稅務(wù)局負責(zé)征收管理，稅款繳入中央金庫；

　?。ǘ┛蒲袡C構(gòu)移交給地方各部門、各總公司、各行業(yè)協(xié)會、總會及其所屬企業(yè)、事業(yè)單位和社會團體的，以及上述企事業(yè)單位舉辦的國有企業(yè)的，其企業(yè)所得稅由國家稅務(wù)局負責(zé)征收管理，稅款繳入中央金庫；

　?。ㄈ┛蒲袡C構(gòu)移交給集體所有制企業(yè)的，其企業(yè)所得稅由地方稅務(wù)局負責(zé)征收管理，稅款繳入地方金庫；

　　（四）科研機構(gòu)移交給由中央和地方聯(lián)合與其他企業(yè)（包括集體、私營企業(yè)）和個人組成的股份制企業(yè)、聯(lián)營企業(yè)的，其企業(yè)所得稅仍按原規(guī)定由國家稅務(wù)局負責(zé)征收管理，稅款按加入移交企業(yè)后中央與地方各自所占比例分別入中央金庫、地方金庫。

　　三、科研單位移交前的欠稅，應(yīng)當及時清繳；未能清繳的，應(yīng)隨同本單位的其他債權(quán)債務(wù)一并移交，并按國務(wù)院有關(guān)文件要求進行清欠?？蒲袡C構(gòu)移交后，應(yīng)當及時向原主管稅務(wù)機關(guān)繳銷發(fā)票、辦理注銷稅務(wù)登記和其他有關(guān)涉稅事項，并在重新辦理工商登記后，向主管稅務(wù)機關(guān)重新辦理稅務(wù)登記。

　　附件：國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個國家局所屬242個科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制方案（略）