在對存貨損失的處理上，會計制度規(guī)定：由于預見存貨可能遭受損失或不合市價，出于會計上的“謹慎性”，企業(yè)在期末要計提“存貨跌價準備”，但稅法上不予認可；對于正常的存貨損失，會計處理等同于稅法，在本年利潤中直接扣除；對于存貨的非正常損失，會計上分兩種情況在本年利潤中直接扣除，即自然災害損失，在扣除保險公司等賠償后記入“營業(yè)外支出”，而因管理不善造成貨物被盜竊、發(fā)生霉爛變質(zhì)等損失，扣除有關(guān)責任人員賠償后記入“管理費用”。
一、存貨損失的稅收處理
1、增值稅方面
企業(yè)發(fā)生非正常損失的購進貨物，其進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。如果企業(yè)在貨物發(fā)生非正常損失之前，已將該購進貨物的增值稅進項稅額實際申報抵扣，則應(yīng)當在該批貨物發(fā)生非正常損失的當期，將該批貨物的進項稅額予以轉(zhuǎn)出。
2、所得稅方面
對于因“管理不善”記入“管理費用”和因“自然災害”記入“營業(yè)外支出”的存貨非正常損失，如果具備第13號令中規(guī)定認定的證據(jù)，經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審查批準后，準予在當期稅前扣除。
二、存貨損失的會計處理
某內(nèi)資企業(yè)系一般納稅人，2006年不包括以下經(jīng)濟業(yè)務(wù)的情況下的會計利潤為200萬元，應(yīng)交增值稅金已足額上交，其它會計資料反映情況如下：
已計提存貨跌價準備15萬元；因倉庫保管員王某放松責任心，導致倉庫原材料被盜，經(jīng)盤查，材料賬面價值為50000元（其中含分攤的運費4650元）；意外火災造成庫存產(chǎn)品全部燒毀，該產(chǎn)成品的非正常損失金額40萬元。已知全年總計耗用存貨金額500萬元，全年生產(chǎn)成本金額800萬元；12月份盤虧一批8月份購入的材料（已抵扣進項稅額），盤虧金額為9萬元，查明屬于定額內(nèi)自然損耗；以上材料進項稅稅率為17%，不考慮其他稅費和納稅調(diào)整。
根據(jù)上述材料，該企業(yè)應(yīng)進行如下賬務(wù)處理：
1.存貨跌價準備只影響計稅所得額，即調(diào)贈應(yīng)納稅所得額15萬元，并不影響會計利潤額，故不必作調(diào)賬分錄；
2.被盜材料進項稅額轉(zhuǎn)出＝（50000－4650）×17%＋4650÷（1－7%）×7%＝8059.50元，
借：待處理財產(chǎn)損溢 58059.50
貸：原材料 50000
應(yīng)交稅金———應(yīng)交增值稅（進項稅額轉(zhuǎn)出）8059.50
2006年12月20日經(jīng)董事會批準，由王某賠償2萬元，并報經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審批同意后，
借：管理費用 38059.50
其他應(yīng)收款———王某 20000
貸：待處理財產(chǎn)損溢 58059.50
3.被毀產(chǎn)成品的進項稅轉(zhuǎn)出額＝（產(chǎn)成品的損失金額×全年耗用存貨金額÷全年生產(chǎn)成本金額）×適用稅率＝（40×500÷800）×17%＝4.25萬元，
借：待處理財產(chǎn)損溢 442500
貸：產(chǎn)成品 400000
應(yīng)交稅金———應(yīng)交增值稅（進項稅額轉(zhuǎn)出）42500
2006年12月20日經(jīng)董事會批準，并報經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審批同意后，
借：營業(yè)外支出 442500
貸：待處理財產(chǎn)損溢 442500
4.盤虧入賬時：
借：待處理財產(chǎn)損溢 105300
貸：原材料 90000
應(yīng)交稅金———應(yīng)交增值稅（進項稅額轉(zhuǎn)出）15300
根據(jù)第13號令，定額內(nèi)合理損耗，屬正常損失，不必報經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審批，直接在當年所得稅前扣除，
借：管理費用———定額損耗 105300
貸：待處理財產(chǎn)損溢 105300
根據(jù)上述業(yè)務(wù)，該企業(yè)應(yīng)交增值稅＝8059.50＋42500＋15300＝65859.50元，應(yīng)稅所得額＝2000000＋150000－38059.50－442500－105300＝1564140.50元，應(yīng)交所得稅＝1564140.50×33%＝516166.37元。
需要注意的是，如果以上非正常損失當年未報稅務(wù)機關(guān)批準，則不允許在當年及以后年度抵扣；對于正常損耗，雖少了審批這一程序，但也要在證據(jù)確鑿后才在當年扣除。