企業(yè)所得稅法上所稱“公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)”是指納稅人通過(guò)中國(guó)境內(nèi)非營(yíng)利性的社會(huì)團(tuán)體、國(guó)家機(jī)關(guān)向教育、民政等公益事業(yè)和遭受自然災(zāi)害地區(qū)、貧困地區(qū)的捐贈(zèng)。公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)是屬企業(yè)自愿的、合理合法的費(fèi)用支出項(xiàng)目。但從國(guó)家的根本利益出發(fā)，公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)直接侵蝕企業(yè)所得稅稅基，從而影響國(guó)家財(cái)政收入。捐贈(zèng)如果在企業(yè)所得稅稅前扣除上不加以限制，就相當(dāng)于納稅人將一部分屬于國(guó)家的稅收一并予以捐贈(zèng)。所以，依據(jù)公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)的性質(zhì)、對(duì)象不同，企業(yè)所得稅規(guī)定了3%、10%、1.5%不等的扣除限制（全額扣除除外），而扣除基數(shù)是依據(jù)“納稅人年度應(yīng)納稅所得額”。而何為“應(yīng)納稅所得額”？
按照《企業(yè)所得稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》的規(guī)定，“應(yīng)納稅所得額”=收入總額-準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目金額。公益性捐贈(zèng)同樣是屬準(zhǔn)予扣除的項(xiàng)目，所以，從嚴(yán)格意義上講，捐贈(zèng)扣除限額=（不含捐贈(zèng)的納稅所得額-準(zhǔn)予扣除的捐贈(zèng)金額）*準(zhǔn)予扣除的比例。但如此計(jì)算捐贈(zèng)限額比較繁瑣，為了便于計(jì)算，國(guó)稅發(fā)[1994]第 229號(hào)文規(guī)定：“企業(yè)的公益性、救濟(jì)性捐贈(zèng)可以在應(yīng)納稅所得額3%以內(nèi)的部分予以扣除，為了計(jì)算簡(jiǎn)便，現(xiàn)將具體計(jì)算程序明確如下：（一）調(diào)整所得額，即將企業(yè)已在營(yíng)業(yè)外支出中列支的捐贈(zèng)額剔除，計(jì)入企業(yè)的所得額；（二）將調(diào)整后的所得額乘以3%，計(jì)算出法定公益性、救濟(jì)性捐贈(zèng)扣除額；（三）將調(diào)整后的所得額減去法定的公益性、救濟(jì)性捐贈(zèng)扣除額，其差額為應(yīng)納稅所得額。企業(yè)當(dāng)期發(fā)生的公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)不足所得額的3%的，應(yīng)據(jù)實(shí)扣除�！痹撘�(guī)定既方便于稅務(wù)機(jī)關(guān)的計(jì)算又有利于納稅人。
但原有《企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表》即（國(guó)稅發(fā)[1998]190號(hào)）文中對(duì)捐贈(zèng)扣除卻規(guī)定為：公益救濟(jì)性捐贈(zèng)的扣除限額=主表第42行“納稅調(diào)整前所得”*3%，而主表第42行“納稅調(diào)整前所得”為主表第14行-第15行-第16行，第16行為“期間費(fèi)用”，該期間費(fèi)用中包括了企業(yè)在“營(yíng)業(yè)外支出”、主營(yíng)業(yè)務(wù)稅金及附加等科目中發(fā)生的允許稅前扣除的項(xiàng)目，并且“期間費(fèi)用”中明確列舉了納稅人的“捐贈(zèng)支出”。這就是說(shuō)，該捐贈(zèng)是根據(jù)收入總額扣除允許扣除項(xiàng)目所發(fā)生的全部金額后的余額作為扣除的基數(shù)。該規(guī)定顯然是與企業(yè)所得稅政策相違背：首先是對(duì)已在營(yíng)業(yè)外支出的捐贈(zèng)支出未予以剔除。其次，該規(guī)定錯(cuò)誤的將“準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目金額”理解為“準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目的全額”。從企業(yè)所得稅的角度，納稅人所有發(fā)生的成本、費(fèi)用、稅金、損失中分為“準(zhǔn)于扣除的項(xiàng)目”和“不準(zhǔn)予扣除的項(xiàng)目”兩大類(lèi)，“不準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目”中，不論發(fā)生金額的大小，一律不得稅前扣除。而在“準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目”中并非是一律全額扣除，對(duì)有一些扣除項(xiàng)目，企業(yè)所得稅進(jìn)行了限制。所以“準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目金額”與“準(zhǔn)予扣除項(xiàng)目的全額”是兩個(gè)不同的概念�！皽�(zhǔn)予扣除項(xiàng)目金額”有兩層含義：一是必須是企業(yè)所得稅規(guī)定的允許扣除的項(xiàng)目；二是必須是準(zhǔn)予扣除的年度應(yīng)納稅所得額金額，對(duì)超過(guò)企業(yè)所得稅規(guī)定的額度的，不允許稅前扣除。由于這兩點(diǎn)都是對(duì)納稅人利益的傷害，由此造成征納雙方的矛盾是不可避免的。
而新修訂的《企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表》（國(guó)稅發(fā)[2006]56號(hào)）文就解決了這一矛盾：一是剔除了捐贈(zèng)支出。根據(jù)國(guó)稅發(fā)[2006]56號(hào)文規(guī)定：附表二（1）《成本費(fèi)用明細(xì)表》第17行“其他扣除項(xiàng)目合計(jì)”填入主表的第7行“其他扣除項(xiàng)目”，而附表二（1）《成本費(fèi)用明細(xì)表》第17行“其他扣除項(xiàng)目合計(jì)”=本表第18+26行。填表說(shuō)明為：第18至25行“營(yíng)業(yè)外支出”填報(bào)納稅人按照會(huì)計(jì)制度核算的“營(yíng)業(yè)外支出”中剔除捐贈(zèng)支出后的余額，依據(jù)稅收政策規(guī)定可以扣除的項(xiàng)目（“依據(jù)稅收政策規(guī)定可以扣除的項(xiàng)目”是新所得稅報(bào)表中的一個(gè)疏忽：新所得稅報(bào)表是對(duì)不論是允許稅前扣除項(xiàng)目，還是不允許稅前扣除項(xiàng)目，除了捐贈(zèng)支出剔除外，均先計(jì)入納稅調(diào)整前所得，然后對(duì)不允許稅前扣除的項(xiàng)目以及超過(guò)允許稅前扣除限額的金額作納稅調(diào)整處理。所以，應(yīng)刪除“依據(jù)稅收政策規(guī)定可以扣除的項(xiàng)目”。）。并且該填表說(shuō)明中明確：“按照會(huì)計(jì)制度核算在'營(yíng)業(yè)外支出' 列支的各項(xiàng)捐贈(zèng)支出（包括公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)支出，非公益救濟(jì)性捐贈(zèng)支出）不在本表二填報(bào)，而在附表八《捐贈(zèng)支出明細(xì)表》中填報(bào)�！�。并且在納稅調(diào)整增加項(xiàng)目明細(xì)表（企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表附表4）中不包含捐贈(zèng)項(xiàng)目。也就是說(shuō)，該規(guī)定對(duì)已在營(yíng)業(yè)外支出中列支的捐贈(zèng)額剔除，計(jì)入企業(yè)的所得額。并且不論納稅人是公益、救濟(jì)性捐贈(zèng)或是非公益救濟(jì)性捐贈(zèng)，一律予以剔除（從嚴(yán)格意義上，非公益救濟(jì)性捐贈(zèng)是屬不允許稅前扣除項(xiàng)目），其實(shí)質(zhì)上也就是加大了納稅人的捐贈(zèng)基數(shù)，對(duì)企業(yè)更加有利。
捐贈(zèng)的基數(shù)為年度應(yīng)納稅所得額。根據(jù)國(guó)稅發(fā)[2006]56號(hào)文規(guī)定：允許扣除的公益救濟(jì)性捐贈(zèng)的計(jì)算基數(shù)為申報(bào)表主表第16行“納稅調(diào)整后所得”，“納稅調(diào)整后所得”為主表的第13+第14-第15，而第13行為“納稅調(diào)整前所得”，第14行為“納稅調(diào)整增加額”，第15行為“納稅調(diào)整減少額”，“納稅調(diào)整前所得”+“納稅調(diào)整增加額”-“納稅調(diào)整減少額”方為企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額�！凹{稅調(diào)整前所得”雖然包括了企業(yè)所得稅中不允許扣除的項(xiàng)目，但所有不允許扣除的項(xiàng)目以及超過(guò)允許扣除項(xiàng)目限額的，在“納稅調(diào)增項(xiàng)目”中進(jìn)行了相應(yīng)的納稅調(diào)整。
總之，新的企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表是按照企業(yè)所得稅應(yīng)確定的收入總額減去會(huì)計(jì)上確認(rèn)的除捐贈(zèng)（包括公益性捐贈(zèng)和非公益性捐贈(zèng)）外的所有支出項(xiàng)目以及按照企業(yè)所得稅的規(guī)定應(yīng)確認(rèn)的扣除項(xiàng)目的余額為“納稅調(diào)整前所得”，爾后按照企業(yè)所得稅的規(guī)定調(diào)增或調(diào)減所得額，捐贈(zèng)是按照調(diào)整后的應(yīng)納稅所得作為扣除的基數(shù).