生產(chǎn)企業(yè)騙取出口退稅款的，由稅務機關(guān)追繳其騙取的退稅款，并處騙取退稅款一倍以上五倍以下罰款；并由省級以上（含省級）稅務機關(guān)批準，停止其半年以上出口退稅權(quán)。在停止出口退稅權(quán)期間，對該企業(yè)自營、委托或代理出口的貨物，一律不予辦理出口退（免）稅。涉嫌構(gòu)成犯罪的，移送司法機關(guān)依法追究刑事責任。
對故意接受虛開增值稅專用發(fā)票或者故意接受虛開可抵扣稅款的其他發(fā)票（憑證）偷逃稅款、騙取出口退稅的，各地稅務機關(guān)必須至少對其三年內(nèi)的稅收繳納情況進行全面檢查；凡檢查發(fā)現(xiàn)問題的，還要依法追溯到以前年度。經(jīng)調(diào)查取證認定為故意接受虛開發(fā)票的，要排除各方干擾，依法從重處罰，不得以任何理由拖延推諉。
商規(guī)發(fā)[2004]363號文規(guī)定，對從事“四自三不見”業(yè)務、涉嫌騙取出口退稅或騙取出口退稅的出口企業(yè)，各級商務、稅務部門要依法查處，并依法嚴肅處理。該予以行政處罰的，要依法予以行政處罰；該移送公安機關(guān)立案查處的，要移送公安機關(guān)立案查處；構(gòu)成犯罪的，要移送司法機關(guān)追究其單位及責任人的法律責任。
另外，國稅發(fā)[2005]72號規(guī)定對有偷稅、騙取出口退稅等涉稅違法行為的企業(yè)和有涉嫌涉稅違法正在接受審查的企業(yè)，不得申請國家認定企業(yè)技術(shù)中心。稅務部門在接到同級企業(yè)技術(shù)中心主管部門抄送推薦的國家認定企業(yè)技術(shù)中心名單后，應對推薦企業(yè)是否有該款列明的情況進行核實，并將結(jié)果于7月15日前報至總局。對已被認定為國家認定企業(yè)技術(shù)中心的企業(yè)，有偷稅、騙取出口退稅等涉稅違法行為的，要撤消其國家認定企業(yè)技術(shù)中心資格。稅務部門應將有問題的已認定為國家認定企業(yè)技術(shù)中心的企業(yè)名單及相關(guān)情況，于每年7月15日前報至總局，可與推薦企業(yè)的核實情況一同上報。